1614 m. salą atrado olandų keliautojas Janas Majus. 1929 m. sala oficialiai prijungta prie Norvegijos. Nuo 1995 m. administruojama Nordlando apskrities.
Jan Majenas yra vulkaninės kilmės, iš dalies padengtas ledynais (ledynų plotas 117 km²). Sala sudaryta iš dviejų salų: didesnės šiaurinės ir mažesnės pietinės, kurias jungia 2,5 km pločio sąsmauka. Manoma, kad salos amžius apie 700 tūkstančių metų.
Aukščiausias salos taškas yra Berenbergo ugnikalnis (2277 m). Tai pats šiauriausias veikiantis ugnikalnis visoje Žemėje. Nuo 1732 m. iki 1985 m. užfiksuoti 6 išsiveržimai.
Vidutinė salos temperatūra vasarą būna +5 °C (didžiausia užfiksuota buvo +18 °C). Žiemą -5 °C (retkarčiais būna -20 °C). Tokį klimatą lemia Golfo srovė.
