Komandorija (angl. commandry (britų), commandery (JAV)) - mažiausias administracinis riterių ordino valdomų žemių vienetas. Komandoriją paprastai sudarydavo pilis ir ją supančios, iš jos valdomos žemės. Komandoriją valdė komandoras.
Žodis komandorija kilęs iš pranc. commanderie, o šis - iš lot. commendaria (commendare 'patikėti, pavesti'). Lotyniškai komandoriją vadindavo ir commendæ.
Pirmosios komandorijos buvo sukurtos Hospitaljerų (Maltos) Ordino žemėse, vėliau - Vokiečių ordino ir kitų riterių ordinų valdose. Vokiečių ordino komandorijos vadinamos komtūrijomis. Tamplierių ordino komandorijos vadinosi preceptorijos.