In 1671 wijdde de aartsbisschop van Mechelen, Alphonsus van Bergen hem tot bisschop van Ieper, een bisdom in Spaans-Vlaanderen. Een jaar later deed hij zijn plechtige intrede in Ieper. Dit bisdom was, zo vele jaren na de dood van bisschop Jansenius (1638) nog steeds verdeeld tussen voor- en tegenstanders van het jansenisme.[2] De jaren leegstand van de bisschopszetel en ook de inval van Franse troepen tijdens de Hollandse Oorlog hadden het bisdom in chaos gestort. Bisschop van Halmale zette zich energiek aan het werk. Hij koos ervoor de naam van bisschop Jansenius weg te kappen van het graf in de kathedraal. Dit gaf luid protest en leidde tot pogingen om het graf in eer te herstellen. Van Halmale bleef bij zijn stelling ut dispereat memoria eius – dat de herinnering aan deze man verdwijne – en kreeg gelijk van de Spaanse overheid. Toen hijzelf overleed in 1676 werd hij begraven naast Jansenius.[3]