Santo Tomás is een stad en gemeente in het Nicaraguaanse departement Chontales. In 2015 had Santo Tomás 18.900 inwoners op een oppervlakte van 546,60 km².
Santo Tomás heeft een stedenband met:
Acoyapa · Comalapa · El Coral · Juigalpa · La Libertad · San Francisco de Cuapa · San Pedro de Lóvago · Santo Domingo · Santo Tomás · Villa Sandino