Mude, zoals Sint Anna ter Muiden aanvankelijk heette, kreeg stadsrechten in 1242. In de Middeleeuwen was het een belangrijke handelsstad en een voorhaven van Brugge. Na verzanding van de haven in de 14e eeuw kwijnde de stad weg ten gunste van het naburige Sluis. In 1405 werd Mude op de kerk na volledig platgebrand door de Engelsen. Bij vastlegging van de grens tussen de Republiek der Zeven Verenigde Nederlanden en de Spaanse Nederlanden, begin 17e eeuw, kwam Mude uiteindelijk net in de Republiek te liggen. Om het vervolgens te kunnen onderscheiden van het Noord-Hollandse Muiden, werd de naam van de beschermheilige aan de plaatsnaam toegevoegd. In die tijd was de rol van Sint Anna ter Muiden reeds uitgespeeld. Wat overbleef was de kleine, rustieke woonkern die het nog altijd is.
In 1880 werd de gemeente "Sint Anna Termuiden" opgeheven en bij de toenmalige gemeente Sluis gevoegd. Deze gemeente werd in 1995 onderdeel van de gemeente Sluis-Aardenburg, die op haar beurt weer opging in de grotere fusiegemeente Sluis.
Sint Anna ter Muiden ligt in het zeekleipoldergebied op een hoogte van ongeveer 1,5 meter. In de omgeving vindt men diverse historische polderdijken die ook de Belgisch-Nederlandse grens overschrijden. In het zuiden ligt de Damse Vaart en in het nabijgelegen België vindt men kreken en overblijfselen van de Staats-Spaanse Linies, zoals de Linie van Cantelmo.
H. Q. JANSSEN, St. Anna ter Muiden, beschouwd als plaats, sedert het ontstaan der stad Mude in 1241 en als chistelijke gemeente van den aanvang der XVIde eeuw tot op onze dagen, Middelburg, 1850.
Louis GILLIODTS-VAN SEVEREN, Coutumes des petites villes et seigneuries enclavées. Ghistelles, Houcke, Lichtervelde, Maldeghem, Merckem, Mude, Munikerede, Nieuwvliet, Oostburg Brussel, 1891.
Antoine DE SMET, L'origine des ports du Zwin, Damme, Mude, Monikerede, Hoeke et Sluis, in: Etudes d'histoire dédiées à la mémoire de Henri Pirenne, Brussel, 1937.
R. DE MEESTER DE BETZENBROUCK, De opgravingen in Sint-Anna-ter-Muiden in 1962, in: Rond de Poldertorens, 1964.
B. FOSSION, Bruges et les petites villes du Zwin, in: Marc BOONE e.a. (red.), Le réseau urbain en Belgique dans une perspective historique 1350-1850, Brussel, 1992.
Kristiaan DILLEN, Mude, de waterbaljuw en het waterrecht, sleutelactoren in de laatmiddeleeuwse Zwinhaven, in: Handelingen van het Genootschap voor geschiedenis te Brugge, 2022.