De vlag van Abbekerk is op 1 september 2008 door Stichting Historisch Abbekerk-Lambertschaag vastgesteld als de dorpsvlag van de Noord-HollandsedorpAbbekerk. De vlag kan als volgt worden beschreven:
Wit, met in het midden een rode kerk met blauw dak op een groen terras, alles van 13/20 vlaghoogte.
De kerk is ontleend aan het gemeentewapen. De vlag is ontworpen door Hans van Heijningen.
