De vlag van Munstergeleen is op 17 april 1962 vastgesteld als de gemeentelijke vlag van de voormalige LimburgsegemeenteMunstergeleen. Sinds 1 januari 1982 is de vlag niet langer als gemeentevlag in gebruik omdat de gemeente Munstergeleen toen opging in de gemeente Sittard. De vlag kan als volgt worden beschreven:
Twee even hoge banen, van blauw beladen met een wit zwaard, en van rood, beladen met een witte tang, en een broekdriehoek van geel, met een zwart slangenkopkruis.
De kleuren en het ontwerp zijn ontleend aan het gemeentewapen. het witte zwaard staat voor de H. Pancratius, de tang voor de H. Appolonia.