Allfarth ble født i Leipzig. Han fullførte skolen i 1917, og studerte deretter handelsfag hos Siemens-Schuckert. I 1923 flyttet han til München for å drive som handelsmann.
Den 9. november 1923 deltok han i marsjen mot Feldherrn Halle, og han ble skutt av politiet i sammenstøtet som fulgte. Det ble hevdet at han sang «Deutschland über Alles» da han ble skutt. Allfarth var en av de mest kjente av nazimartyrene, av den enkle grunn at hans navn havnet først i den alfabetiske listen.