Filippo Archinto var pavelig byråkrat, guvernør av Roma og pavelig vikar av Roma. Han ble presteviet av Giovanni Battista Castagna.
Han ble den 19. mars 1539 utnevnt til biskop av Sansepolcro (Borgo San Sepolcro), det er ikke avklart hvem som bispeviet ham. Den 19. oktober 1546 ble han utnevnt til biskop av Saluzzo. i 1554 ble han apostolisk nuntius til Republikken Venezia, og utøvde dette embede til 1556.
Den 16. desember 1556 ble han promovert til erkebiskop av Milano. Han døde i Bergamo den 21. juni 1558, i en alder av 57 år.