Berle var utdannet bygningsingeniør fra Kristiania tekniske skole og arbeidet som assistent hos Henrik Thrap-Meyer fra 1880 til 1886. Han utdannet seg til arkitekt i Berlin i årene fra 1886 til 1890.
Etter arkitektutdannelsen arbeidet Berle tre år i Kristiansand, der man hadde stort behov for arkitekter til gjenoppbyggingen etter den store bybrannen i 1892. Fra 1895 drev han egen arkitektpraksis i Kristiania, der han også drev en fabrikk som laget bygningsdeler i terrakotta. Rundt 1900 tegnet Berle Egebergslottet i Gamle Aker. Etter Første verdenskrig var Berle bosatt i København.
Berle var sønn av Cort Reimers Berle (1822–82) og Maria Jacobine Keyser (1826–1917). Faren var skoleinspektør i Halden. Broren Jakob Keyser Berle (1859–1938) var bestyrer ved Berles skole i Kristiania, som forøvrig Halfdan hadde tegnet selv i 1898.
Arbeider i utvalg
Tidligere Berle skole, nå Steinerskolen i Professor Dahls gate 30, Oslo
