Kim ble født i 1960 i Bonghwa i Sør-Korea. Da han var ni år gammel flyttet familien til Seoul, der han etterhvert gikk på en yrkesskole rettet mot jordbruk. Etter den obligatoriske skolegang, da han var blitt 17 år, var familien havnet i økonomiske vanskeligheter. Han arbeidet så i fabrikk til han ble tyve år gammel. Så gikk han inn i marinen, og tjenestegjorde der i fem år.
Han ble på denne tid sterkt dradd mot det religiøse; han kom i kontakt med en kirke som tok seg av synshemmede, og han funderte på å bli predikant.
Han flyttet så fra hjemlandet og studerte kunst i Paris fra 1990 til 1992. Kim Ki-duk hadde innen sitt gjennombrudd som regissør overhodet ingen filmutdannelse; studiene i Paris var ikke inne på film. Han var imidlertid filminteressert og begynte med skrive manus. Hans talent ble oppdaget da han i 1995 vant førstepremien i en manuskonkurranse arrangert av Det koreanske filmråd.
Kim opererte som regel innen sjangrene drama eller thriller. Filmene hans er svært dvelende, med ofte lange tagninger. Han var sparsom med bruken av dialog i filmene sine. I Tomme hus (2005) for eksempel sier ikke hovedpersonen et eneste ord i løpet av hele filmen.
Hans filmer var som oftest lagt i et pessimistisk-lakonisk toneleie, fulle av arkatiske voldsutbrudd fra hans ofte kommunikativt forstyrrede protagonister. I Sør-Korea heftet det især etter filmen Bad Guy et kvinnefiendtlig image ved ham, noe han selv holdt for å være en misoppfatning.
Den 11. desember 2020 døde Kim Ki-duk på et sykehus i Riga i Latvia av komplikasjoner forårsaket av COVID-19, i en alder av 59 år, bare noen få dager før sin 60-årsdag[9][10]
Filmografi
Komplett liste over alle filmene Kim har regissert (han har skrevet manus til alle bortsett fra Breath):