Pierwsza edycja rajdu odbyła się w roku 1968, start był w Olsztynie, meta w Starych Jabłonkach, trasa liczyła 1068 kilometrów, a impreza nosiła nazwę Rajdu 1000 jezior. Inicjatorem i pomysłodawcą rajdu był Włodzimierz Śniady. Rajd ten był pierwszą i jedyną przez lata imprezą rozgrywaną na szutrze. Z racji tego, że organizatorzy rajdu mieli go zgłosić Fédération Internationale de l’Automobile, musiano zmienić jego nazwę, gdyż w kalendarzu FIA był już Rajd Tysiąca Jezior rozgrywany od lat w Finlandii. W następnym roku rajd nazywał się Rajdem 1001 jezior, potem Mazurskim i wreszcie w roku 1972 – Kormoran i tak jest do dziś. W tym roku rajd miał charakter zlotu gwiaździstego, na wzór Rajdu Monte Carlo. Od roku 1974 organizatorem jest Auto-Moto-Klub Stomil. W latach 1978–1982 nie był rozgrywany. W latach osiemdziesiątych i dziewięćdziesiątych wspierany przez dwóch czołowych kierowców tamtych lat, pochodzących z Olsztyna Mariana Bublewicza i Krzysztofa Hołowczyca. Od samego początku, do roku 2004 był jedną z eliminacji Rajdowych samochodowych mistrzostwa Polski[1][2].
