Zespół po raz pierwszy awansował do Ligue 1 w 1988 i występował w niej kilka sezonów. W 1996 wywalczył mistrzostwo Ligue 2 i na jeden sezon wrócił do najwyższej klasy rozgrywkowej. Kolejny awans świętował w sezonie 2003/2004, po zajęciu 2. miejsca w Ligue 2. W sezonie 2004/2005 zespół, pomimo spadku do Ligue 2, osiągnął największy sukces w swojej historii, jakim było dojście do finału Pucharu Ligi, w którym Caen przegrało z RC Strasbourg 1:2. W 2009 klub zajmując 18. miejsce spadł z francuskiej ekstraklasy. Po rocznej banicji powrócił do Ligue 1[3].
Q – runda eliminacyjna, 1/16, 1/8, 1/4, 1/2 – odpowiednia faza rozgrywek, Grupa – runda grupowa, 1r gr – pierwsza runda grupowa, 2r gr – druga runda grupowa, F – finał, R – runda, PO – play-off
k. – rzuty karne, los. – losowanie, Dogr. – dogrywka, w. – zasada bramek strzelonych na wyjeździe