Synagoga Jochanan ben Zakai w Jerozolimie (hebr. בית הכנסת יוחנן בן זכאי) – synagoga znajdująca się w Dzielnicy Żydowskiej Starego Miasta w Jerozolimie, wchodząca w skład tzw. czterech synagog sefardyjskich.
Według legendy synagoga Jochanan ben Zakai, zwana też Kahal Kadosz Gadol, powstała na miejscu bejt midraszu rabina Jochanana ben Zakajego, który założył Sanhedryn w Jawne po zniszczeniu Drugiej Świątyni Jerozolimskiej. Obecny budynek powstał na początku XVII wieku (zapewne przed 1615). Synagoga jest położona nieco poniżej poziomu ulicy.
Synagoga podczas I wojny izraelsko-arabskiej w 1948 roku i w okresie rządów jordańskich została zdewastowana. Po wojnie sześciodniowej i odzyskaniu przez Izrael kontroli nad Starym Miastem synagoga została odnowiona i ponownie oddana do użytku.
