W latach 1939–1941 wykładał na franciszkańskiej uczelni St. Bonaventura College, a następnie pracował w czarnym getcie Harlemu, pośród ubogich Afroamerykanów. Studiowanie tekstów św. Jana od Krzyża przyniosło w 1941 decyzję o wstąpieniu do klasztoru zakonu trapistów w Gethsemani. 17 marca 1947 roku złożył profesję wieczystą, a 26 maja roku 1949 przyjął święcenia kapłańskie[1]. Następnie sprawował funkcję mistrza nowicjatu (1955–1965). Zmarł 10 grudnia 1968 w jednym z hoteli Bangkoku, porażony prądem elektrycznym w łazience[2].
Thomas Merton. Życie w listach (ang. Thomas Merton. A life in letters: The Essential Collection by Thomas Merton edited by William H. Shannon and Christine M. Bochen); Poznań 2011, Wydawnictwo W drodze; ISBN 978-83-7033-787-2
Mistyka chrześcijańska. Trzynaście spotkań ze słynnym trapistą (ang. A Course in Christian Mysticism); Poznań 2019, Wydawnictwo W drodze; ISBN 978-83-7906-234-8