Durante os primeiros cinco anos da sua existência, este parlamento terá apenas as funções de verificar o funcionamento dos outros parlamentos do continente, aconselhá-los e responder a questões que lhe sejam formuladas. Depois deste período o Parlamento Panafricano passará a ter poderes legislativos, como qualquer outro.
Os seus 265 parlamentares são eleitos pelas legislaturas dos 53 estados-membros. A sede do Parlamento Panafricano é em Midrand, África do Sul.