A Universidade de Zagreb foi fundada em 1669 como Universitas Studiorum Zagrabiensis ("Universidade de Estudos Zagrebenses", em latim). Em 2011, figurava entre as 500 Melhores Universidades do Mundo no ranking de Xangai. Desde 1874, mais de 200.000 alunos já receberam diploma de bacharelado, mais de 18.000 concluíram mestrado e mais de 8.000 fizeram o doutorado na instituição.
História
Os primórdios da universidade datam de 23 de setembro de 1669, quando o imperador Leopoldo I de Habsburgo autorizou por decreto a criação da Academia Jesuíta da Real Cidade Livre de Zagreb. De acordo com esse documento, o estudo da Filosofia em Zagreb adquiriu um status formal e legal, com a Neoacademia Zagrabiensis tornando-se oficialmente uma instituição pública de ensino superior.
A academia foi administrada pelos jesuítas por mais de um século, até a ordem ser dissolvida pelo Papa Clemente XIV, em 1773. Sob uma nova liderança, em 1772, a academia matriculou um total de 200 alunos.
Em 1776, a imperatriz Maria Teresa da Áustria decretou a fundação da Real Academia de Ciências (em latim: Regia Academia Scientiarum). Ela consistia de três faculdades: Filosofia, Teologia e Direito. Os antigo curso de Política passou a fazer parte da recém-criada Faculdade de Direito e, portanto, foi integrados à academia. Cada uma das faculdades da Academia Real das Ciências tinha várias cátedras ensinando um ou vários cursos. Até 1874, apesar de inúmeras mudanças organizacionais, a Academia de Zagreb continuou como a principal instituição do ensino superior na Croácia, educando a maioria dos membros da intelligentsia croata.
Em 1861, o bispo José Jorge Strossmayer propôs ao parlamento croata a fundação de uma universidade em Zagreb. Durante sua visita a Zagreb, em 1869, o imperador Francisco José assinou o decreto de criação da Universidade de Zagreb. Cinco anos mais tarde, o parlamento aprovou o Ato de Fundação, ratificado pelo imperador em 5 de janeiro de 1874. No dia 19 de outubro daquele ano, foi realizada uma cerimônia de fundação da Universidade de Zagreb, tornando-se a terceira universidade no Reino da Hungria, então parte do Império Austro-Húngaro.
No momento de criação, a Universidade tinha quatro faculdades:
Direito e Estatalidade (Pravno-državoslovni fakultet)
Teologia (Bogoslovni fakultet)
Filosofia (Mudroslovni fakultet)
Medicina (Liječnički fakultet)
A Faculdade de Medicina, no entanto, não funcionou até 1917. A Faculdade de Filosofia servia como unidade de pesquisa científica em geral. Desde 1876, oferecia cátedras de Geologia, Botânica, Física, Matemática e Química; desde 1877, Zoologia; desde 1882, Farmácia; e, desde 1883, Geografia.
Em 1860, foi fundada a Escola de Pecuária e Engenharia Florestal, originalmente em Križevci. Em 1898, a Academia de Engenharia Florestal (Šumarska Akademija) foi fundada como parte da Faculdade de Filosofia, que englobou todos os estudos técnicos. Em 1919, a escola tornou-se a Faculdade de Economia Rural e das Florestas.
Em 1919, foi fundada a Escola Superior de Tecnologia (Tehnička visoka škola), depois transformada em faculdade em 1926. Também em 1919, foi fundada a Escola de Veterinária (Veterinarska visoka škola), transformada em faculdade em 1925.
Uma grande reorganização ocorreu na Faculdade de Filosofia, na década de 1920, com a separação dos cursos de Matemática, Farmácia e outras ciências, primeiro com a criação da Faculdade de Matemática separada e departamentos de Farmacêutica em 1928, quando a faculdade foi renomeada para seu atual nome, Filozofski fakultet.
Em 1926, a Universidade era composta por sete faculdades:
Teologia (Bogoslovni fakultet)
Direito (Pravnički fakultet)
Medicina (Liječnički fakultet)
Filosofia (Mudroslovni fakultet)
Depto. de Filosofia (Filozofski odjel)
Depto. de Farmácia (Farmaceutski odjel)
Pecuária e Engenharia Florestal (Gospodarsko-šumarski fakultet)
Veterinária (Veterinarski fakultet)
Tecnologia (Tehnički fakultet)
Depto. de Construção Civil (Građevni odsjek)
Depto. de Engenharia (Strojarski odsjek)
Depto. de Química (Kemijski odsjek)
Durante a Segunda Guerra Mundial, quando os croatas simpatizantes do nazismo fundaram o Estado Independente da Croácia (1941-1945), a universidade foi rebatizada como Universidade Croata (Hrvatsko sveučilište). Os departamentos da Faculdade de Filosofia tornaram-se faculdades independentes em 1942, em 1946 (quando a Faculdade de Ciências foi criada) e, finalmente, em 1963.
Em 1956, já sob a Iugosláviasocialista, a Faculdade de Tecnologia foi dividida em quatro faculdades distintas: