Autoritatea sa de funcționare provine dintr-o dispoziție care apare în Carta inițială a Flotei Stelare a Pământului în articolul 14, secțiunea 31, din care derivă numele organizației. Articolul 14, secțiunea 31 permite "nerespectarea regulilor" în timpul unor amenințări extraordinare.
Spre deosebire de alte organizații de poliție secretă din universul Star Trek, cum ar fi Tal Shiar (în Imperiul Romulan) sau Ordinul ObsidianCardassian, Secțiunea 31 nu este o ramură reală a guvernului. Fără a răspunde în fața cuiva, Secțiunea 31 se concentrează asupra amenințărilor externe și urmărește pe cele pe care le identifică prin orice mijloace pe care le consideră potrivite.
Secțiunea 31 a fost cea care a contribuit cel mai mult la victoria coaliției dintre Federație, Imperiul Klingonian și Imperiul Galactic Romulanîn războiul împotrivaDominionului din cauza introducerii unui virus în Marea Legătură, ceea ce a decis în mare parte rezultatul războiului.
Charles Tucker III (Star Trek: Enterprise; The Good That Men Do, Kobayashi Maru, The Romulan War: Beneath the Raptor's Wing, The Romulan War: To Brave the Storm and Rise of the Federation: A Choice of Futures)
Tinh Hoc Phuong (The Good That Men Do)
Peter Lawrence (The Case of the Colonist's Corpse)
Admiral Matthew Dougherty (Star Trek: Insurrection; Section 31: Abyss)
Commander Cortin Zweller (Star Trek: The Next Generation; Section 31: Rogue)
Ambassador Aubin Tabor (Star Trek: The Next Generation; Section 31: Rogue)
Ensign Roberta Luke ("Scientific Method"; Section 31: Shadow)
Cole (Section 31: Abyss)
L'Haan (A Time to Kill, A Time to Heal, Typhon Pact - Zero Sum Game, Typhon Pact - Plagues of Night, Typhon Pact - Raise the Dawn, The Fall - A Ceremony of Losses)
Dietz (A Time to Kill, A Time to Heal)
Vasily Zeitsev (A Time to Kill, A Time to Heal)
Sarina Douglas (Typhon Pact - Zero Sum Game, Typhon Pact - Raise the Dawn, The Fall - A Ceremony of Losses)
Aceste episoade au fost produse după ce Secțiunea 31 a apărut pentru prima dată în episoadele Deep Space Nine listate mai jos, dar prezintă evenimente anterioare acestora în cronologia Star Trek.
