ГУУ является первым учебным заведением, специализировавшимся на управленческом образовании в России и СССР.
В 1885 году было основано Александровское коммерческое училище Московского биржевого общества. Вместе с Николаевским женским коммерческим училищем и Торговой школой имени императора Николая II в 1918 году оно положило начало новому учебному заведению — Московский промышленно-экономический практический техникум.
В 1950 году Московский инженерно-экономический институт возглавила О. В. Козлова, благодаря усилиям которой было начато[когда?] строительство нового комплекса зданий МИЭИ на Рязанском проспекте.
19 декабря1969 года указом Президиума Верховного Совета СССР МИЭИ был награждён орденом Трудового Красного Знамени.
28 марта1975 года приказом Министерства высшего и среднего специального образования СССР Московский инженерно-экономический институт был переименован в Московский институт управления имени Серго Орджоникидзе.
Общежитие № 2 введено в эксплуатацию в 1976 году[1].
В соответствии с требованиями экономики институт первым среди вузов страны открыл подготовку специалистов по организации управления производством.
В 1986 году ректором Московского института управления имени Серго Орджоникидзе избран А. Г. Поршнев.
5 февраля1991 года постановлением Совета Министров СССР Московский институт управления был преобразован в Государственную академию управления. Академия явилась инициатором открытия новых направлений управленческого образования в стране с учётом потребностей рыночной экономики, организовав многопрофильную подготовку кадров для производственного, социального, государственного и муниципального управления.
В 1997 в Обнинске открыт филиал ГУУ, единственный на сегодняшний день.
В 2006 году ректором ГУУ избран А. М. Лялин. 7 февраля2011 года приказом министра образования А. А. Фурсенко от 7 февраля 2011 года № 15-21/25 Лялин освобождён от должности ректора. Приказом министра образования от 11 июля 2011 года № 15-21/139 ректором ГУУ утверждён Виктор Анатольевич Козбаненко.
В соответствии с приказом Министерства образования и науки Российской Федерации № 12-07-03/39 от 11 марта 2013 года В. А. Козбаненко уволен с занимаемой должности.
С 12 марта 2013 года в соответствии с приказом Министерства образования и науки Российской федерации № 12-07-03/40 исполнение обязанностей ректора Государственного университета управления возложено на В. В. Година.
С 13 мая 2015 года должность исполняющего обязанности ректора ГУУ в соответствии с приказом Министерства образования и науки Российской федерации замещал д.э.н., профессор В. В. Строев.
Приказом Министерства образования и науки Российской федерации № 398 от 12.04.2016 ГУУ присоединён к МГЮА[2]. 7 декабря 2016 года в Государственном университете управления состоялось внеочередное заседание Учёного совета, по итогам которого было принято решение о подаче ходатайства в Министерство образования и науки РФ об отмене приказа о реорганизации университета. 31 июля 2017 г. Министр образования и науки России О. Ю. Васильева подписала Приказ об отмене реорганизации Государственного университета управления и Московского государственного юридического университета имени О. Е. Кутафина в единый вуз [1] Согласно Приказу Министерства образования и науки РФ № 12-07-03/127 от 3 августа 2017 года исполняющим обязанности ректора ФГБОУ ВО «Государственный университет управления» с 8 августа 2017 года назначен Иван Васильевич Лобанов.