29 мая2000 (2000-05-29) года пришёл к власти в результате военного переворота[англ.], направленного на нейтрализацию предыдущего переворота. Возглавлял временное военное правительство Фиджи до 13 июля2000 (2000-07-13) года, и передал власть новому правительству президента Хосефа Илоило. Ставленник Мбаинимарамы на посту премьер-министра Лаисениа Нгарасе не во всём соглашался с его инициативами, поэтому 5 декабря2006 (2006-12-05) года Мбаинимарама произвёл военный переворот, став временным президентом страны. Восстановив в следующем году Илоило на посту президента, Баинимарама стал временным премьер-министром.
9 мая 2024 года Мбаинимараму приговорили к одному году лишения свободы за попытку воспрепятствовать отправлению правосудия[3][4].