Родился в 1549 году в Кандии на острове Крит. Учился в Венеции и Падуе. Приняв иночество на родине, открыл при монастыре Ангарафу школу древнегреческого языка, которая приобрела большую известность. Впоследствии был настоятелем этого монастыря.
В 1574 году познакомился в Иерусалиме с патриархом Александрийским Сильвестром, который убедил Мелетия служить Александрийскому престолу и рукоположил его во диакона и священника. В этот момент положение христиан в Египте было довольно тяжёлым. Поражение турецкого флота при Лепанто от союзных сил Венеции, Испании и Италии в 1571 году вызвало погромы египетских христиан, описанные в одном из писем Мелетия. Активизировала прозелитскую деятельность Римская церковь, распространяя различные сочинения, создавая католические школы и пытаясь склонить восточных христиан к принятию григорианского календаря, что категорически отвергли патриарх Константинопольский Иеремия и патриарх Сильвестр. Мелетий Пигас, в то время протосинкелл патриарха Александрийского, составил Александрийский томос, где доказывалось, что реформа календаря противоречит установлениям древней Церкви[1].
Всю жизнь Мелетий провёл в борьбе с папством и готовившейся унией; произнёс массу проповедей и поучений, составивших сборник бесед (греч.στρόματα). Участвуя на Константинопольском соборе в 1593 году, много содействовал учреждению в Москвепатриаршества. Особенно горячее участие Мелетий принимал в делах православия Западной Руси и Польши, по поводу которых им написана большая часть писем и посланий. Убеждая оставаться твёрдыми в православии, Мелетий писал ко многим ревнителям просвещения, например, князю Острожскому, Вишневецкому, Четвертинскому, а также к королю польскому Сигизмунду III и к западнорусским братствам. По поводу учреждения в Москве патриаршества Мелетий писал царю Феодору Иоанновичу, Борису Годунову, патриарху Иову.
Малышевский И. И. Александрийский патриарх Мелетий Пигас и его участие в делах русской церкви, Том 1. — К.: Типография Киево-Печерской лавры, 1872. — 685 с.
Иннокентий (Смирнов), еп. Начертание церковной истории от библейских времен до XVIII в., в пользу духовного юношества. Часть II // Христианское Чтение. — 1862. — № 5.
Βασιλικής Χ. Τζώγα, Το επιγραφόμενο Περί των τω νω συμβαινόντων ανέκδοτο έργο του Μελετίου Πηγά // Φιλολογικό Περιοδικό Παρνασσός, τόμ. ΝΔ΄. — 2012. — P. 298—343.
Vassiliki Tzoga. Un sigillion inédit du patriarche de Constantinople Jérémie II et d' Alexandrie Sylvestre sur la réforme du calendrier // Byzantinische Zeitschrift. — 107/Issue 1. — 2014. — P. 221—252.