Мутемуйя не упоминается в правление своего супруга, пребывая в тени других супруг фараона — Нефертари и Ярет. Изображение Мутемуйи появляется на памятнике её сына Аменхотепа III[1]. Происхождение царицы туманно, а доказательств предположению, будто царица приходилась дочерью митаннийскому правителю Артатаме I, нет[2]. Сирил Олдрид считал Мутемуйю сестрой Йуйи[3].
От разных жён Тутмос IV имел несколько детей. После смерти старшего сына Аменемхета фараон публично объявил наследником Аменхотепа. Когда отец-фараон умер, Мутемуйя стала регентшей при сыне-подростке. На фреске в Луксорском музее мать стоит за троном сына и держит его за плечи.