После этого рукоположене в сан диакона и назначен архидиаконом Смирнской митрополии, где был преподавателем и профессором богословия в евангельском женском училище в Смирне.
В 1899 году был рукоположён в сан пресвитера с возведением в сан архимандрита и направлен в трансильванский Кронштадт (ныне Брашов, Румыния) в Австро-Венгрии[2].
Летом 1919 года митрополит Николай от имени Константинопольской Патриархии принял приглашение организационного комитета Всемирного христианского конгресса в рамках движения «Вера и устройство» участвовать на будущий год в его подготовительной встрече (конференции) в Женеве. При этом митрополит Николай сказал, что Патриархия «протягивает руку помощи трудящимся на том же поле и в том же винограднике Господнем»[3].
21 марта 1921 года был избран Местоблюстителем Константинопольского Патриаршего престола.
В августе 1921 года международный Севрский договор оставил туркам контроль над Константинополем, хотя и защитил права религиозных и национальных меньшинств[3].
