В 1907 году произведён в генералы от кавалерии за отличие[7] (возможно, при подавлении революционных выступлений).
С 08.06.1908 по 24.05.1915 — генерал-губернатор Степного края с центром в городе Омске, Наказной атаман Сибирских казаков и командующий Омским военным округом. Его предшественником на этой должности был генерал Иван Павлович Надаров, первопроходец Уссурийского края.
«Степной генерал-губернатор Е. О. Шмидт (помню его командиром кирасир Его Величества в 1893 году, на подвижных сборах), вернувшись из служебной поездки в Барнаул, был у меня, а я поспешил к нему, отдать визит. Говорят о нем как о грозном, весьма деятельном начальнике зря. Увидав в интендантском вещевом складе никуда не годные сапоги, он отставил от должности интенданта. Из продолжительных бесед с ним вынес тяжелое впечатление о громадной вверенной ему области. Местные условия ужасны: край богато одарен природой, земля таит в огромном количестве уголь, руду, есть целебные источники, несмотря на суровость климата, земля могла бы родить прекрасно, а между тем ничто не разрабатывается, а если и принимаются, то хищнически, думая только о настоящем, о наживе и не заглядывая вперед. В Омске почти никакой растительности: посадят деревцо — сейчас его сломают. Мостовых нет, в сухую погоду пыль слепит глаза, в сырую — грязь невылазная. Множество ссыльных — подонков общества, киргизы в первобытном состоянии.»
↑По одним данным, скончался 15.04.1914 г. По другим, являлся губернатором до 24.05.1915, когда в должность вступил его преемник, генерал Сухомлинов.
↑Список подполковникам по старшинству. Исправлено по 1-е декабря. — СПб., 1879, c. 404
↑Государственный Совет Российской Империи в годы Первой мировой войны (1914-1917). Том 1 / под общ. ред. А.Ю. Шутова. — Москва: Издательство Московского университета, 2020. — С. 238. — 776 с. — ISBN 978-5-19-011557 (т.1).