Джонатан Мейсон родился в Бостоне в семье торговца Джонатана Мейсона (1725—1798) и Мириам Кларк (1724—1774). Посещал Бостонскую латинскую школу, которую окончил в 1774 году. После изучения юриспруденции в Принстонском университете был принят в коллегию адвокатов в 1779 году.
Начиная с 1795 года, Мейсон был партнёром компании Mount Vernon Proprietors, застройщика недвижимости в бостонском районе Бикон-Хилл. Около 1800 года построил для себя особняк на Маунт-Вернон-стрит, в котором прожил до конца своей жизни. Примерно в 1804 году нанял архитектора Чарльза Булфинча, чтобы тот спроектировал четыре дома, также на Маунт-Вернон-стрит, для каждой из своих дочерей; эти дома стоят до сих пор.
Мейсон также был членом Ассоциации Южного Бостона, которая занималась недвижимостью в районе Дорчестере.
С 4 марта 1817 года по 15 мая 1820 года служил в Палате представителей США, после чего ушёл в отставку, чтобы продолжить свою юридическую практику. Умер в Бостоне в возрасте 75 лет. Был похоронен на кладбище Маунт-Оберн в Кембридже[2][3].
Семья
13 апреля 1779 года Джонатан Мейсон женился на Сюзанне Пауэлл (1760—1836). У них было пять дочерей и два сына: