Эрнст Элерс родился 16 октября 1909 года. Изучал медицину. 1 августа 1928 года (по другим данным в 1931 году[2]) вступил в НСДАП (билет № 95459)[3]. В 1932 году был зачислен в ряды СС (№ 307426)[2].
С 1935 года работал в министерстве внутренних дел Саксонии[2]. В 1937 году был переведён в аппарат СД. В 1938 году стал руководителем отдела II (СД) в Главном управлении имперской безопасности[2]. В 1940 году стал начальником гестапо в Лигнице[2]. С июня по ноябрь 1941 года возглавлял в штабе айнзацгруппы B IV отдел (гестапо)[2]. Впоследствии до конца 1943 года был начальником отдела полиции безопасности и СД в Брюсселе, а с 1944 года — представителем руководителя полиции безопасности и СД при военном командиреБельгии и Северной Франции. С 27 июля 1942 по 1944 год в транзитном лагере в Мехелене было организовано множество транспортировок в концлагерь Освенцим, за все составления которых отвечал доктор Элерс. За свою «службу» он получил золотой партийный знак. Кроме того, Элерс был ответственным за дальнейшую депортацию 25 000 евреев в концлагерь Освенцим[4]. С 26 февраля 1944 года и до мая 1945 года был инспектором полиции безопасности и СД в Касселе (IX-й военный округ).
После войны
По окончани войны жил сначала у родственников во Фрайбурге, где с 1957 года работал судьёй административного суда Шлезвига, а через два года стал членом правления этого суда. Многие бывшие нацисты также работали в судебной системе Шлезвиг-Гольштейна.
В феврале 1975 года прокуратура Киля предъявила ему обвинение, но 1-я палата земельного суда Фленсбурга отказалась открывать судебный процесс 27 января 1976 года, на том основании, что обвиняемый якобы не знал куда отправляются депортированные им евреи. В том же году еврейские демонстранты из Бельгии, операторы бельгийского телевидения и Беата Кларсфельд взяли квартиру Элерса в осаду и вывесили на крыше плакат с требованием: «Осудите как можно быстрее Элерса, который несёт ответственность за смерть 25 000 бельгийских евреев».
1 марта 1977 года по требованию прокуратуры уголовный сенат верховного земельного суда Шлезвига передал дело на разбирательство в земельный суд Киля. Элерс, как и другие обвиянемые, подал конституционную жалобу на том основании, что он лишён законного представителя. 23 ноября 1979 года конституционный суд ФРГ отклонил жалобу. 4 октября 1980 года Элерс покончил жизнь самоубийством[2][3][5].
Kerstin Freudiger. Die juristische Aufarbeitung von NS-Verbrechen. — Tübingen: Mohr Siebeck, 2002. — S. 203. — ISBN 978-3-16-147687-7.
Tuviah Friedman. Die Deportation der Juden aus Belgien und Luxemburg während der Nazi-Besetzung 1940—1944: Dokumentensammlung (нем.) // Institute of Documentation in Israel for the Investigation of Nazi War Crimes. — Haifa, 1999.