Hlavný prítok vody zabezpečuje Rieka svätej Kláry, ktorú napája Hurónske jazero a odtok vody prebieha riekou Niagara. Mohutná rieka napája Ontárijské jazero a vytvára sčasti vodnú cestu pre lodnú dopravu. Rieka Niagara je známa hlavne mohutnými Niagarskými vodopádmi, ktoré lode obchádzajú Wellandským kanálom, ktorý je súčasťou Prieplavu svätého Vavrinca – vodnej cesty umožňujúcej námorným lodiam plaviť sa z Atlantického oceánu až do Horného jazera. Voda v jazere je veľmi znečistená a z veľkej časti bez života. Pobrežie jazera je skalnaté, ťažko prístupné a v jazere sa nachádza množstvo ostrovov.
