Juraj Sagan začínal so svojím bratom Petrom. Zo začiatku sa orientoval na horskú cyklistku. Z horskej cyklistiky prestúpil na cestnú, dôvodom bola aj horšia ekonomická perspektíva.[2]
Profesionálna kariéra
Svoju prvú zmluvu podpísal s tímom Dukla Trenčín.[2]
Jeho úlohou v súčasnom tíme Tinkoff-Saxo je podpora vrchárov. Ako povedal v rozhovore pre .týždeň: „Som ten typ jazdca, ktorý vyhrá možno jedny preteky za celú kariéru. Som teda viac-menej robotník, ale bez takých ako som ja by nebolo ani tých najväčších úspechov jednotlivcov.“[2] V tíme bol nespokojný, že ho neposielali na viacej pretekov.[2]
Počas leta (a Tour de France) 2014 sa začalo hovoriť o odchode súrodencov z tímu Cannondale. Podľa Juraja kladie podmienky Peter, Juraj prestúpi s ním. V roku 2015 sa Juraj stal spoločne s Petrom členom ruského tímu Tinkoff-Saxo pod vedením Olega Tinkova.V roku 2018 Peter a Juraj prestúpili do týmu Bora Hansgrohe a v roku 2022 spolu prestúpili do TotalEnergies.
