PubChem je databázachemických látok. Spravuje ju Národné cetrum pre biotechnologické informácie (National Center for Biotechnology Information, NCBI). Databáza obsahuje informácie o látkach s 1000 a menej atómami a/alebo 1000 a menej väzbami. Do PubChemu prispieva viac ako 80 organizácií. Dáta sú prístupné cez webové rozhranie alebo cez FTP.
