Stokes första försök att bli amerikansk senator skedde 1902, sedan William Joyce Sewell avlidit, men han förlorade republikanska nomineringen till John F. Dryden. Stokes vann Republikanernas primärval till USA:s senat med liten marginal. Detta var två år innan senatorer blev direktvalda, Demokraterna kontrollerade delstatens parlament och Stokes blev besegrad.
Han var återigen Republikanernas kandidat till guvernörsposten 1913, men förlorade mot James F. Fielder. Från 1919 till 1927 var han ordförande för New Jerseys Republikanska kommitté. Han kandiderade åter för att bli amerikansk senator 1928, men kom trea i Republikanernas primärval efter Hamilton F. Kean och Joseph Frelinghuysen. Han var valledare för Republikanerna i New Jersey det året.
Stokes var verkställande direktör för Mechanics National Bank i Trenton och ordförande för New Jersey Bankers Association. Han förlorade mycket av sin egen förmögenhet i kraschen på aktiemarknaden och 1939 röstade New Jerseys parlament för att ge honom en pension på 2 500 $ om året. Stokes tackade nej till pengarna och tog i stället ett arbete på delstatens informationskontor.
Stokes avled den 4 november 1942, 81 år gammal. Han är begravd på Mount Pleasant Cemetery i Millville, New Jersey.
