Efter ännu ett skadeuppehåll under 2007 gjorde hon comeback i VM-truppen, och gjorde två mål i genrepet mot Danmark den 30 augusti. Ljungberg var uttagen till OS-truppen 2008, men spelade ingen match på grund av en lårskada.[8]
Den 17 maj 2007 debuterade Hanna Ljungberg som målvakt när Umeå mötte Alvik i Svenska cupen, eftersom Carola Söberg skadades med 20 minuter kvar av matchen. Ljungberg höll nollan.[9]
Den 5 mars2008 blev Ljungberg historisk som den damspelare som gjort flest landskampsmål för Sverige. Hon gjorde då sitt 72:a mål i den blågula tröjan och är därmed etta före Pia Sundhage och Lena Videkull, som båda gjorde 71 landslagsmål. (Sverige mötte Finland i Algarve Cup och vann med 3-1). Detta mål blev också hennes sista i blågult[5]. Rekordet både tangerades och slogs av Lotta Schelin under 2014.[10]
Augusti 2009 meddelade Hanna Ljungberg, efter ytterligare en skada, att hon avslutade sin aktiva karriär som fotbollsspelare.[5]
Hösten 2009 påbörjade Hanna Ljungberg en ny karriär i Umeå IK, som assisterande tränare under dåvarande tränaren Mika Sankala[11]. Efter säsongen 2009 återupptog hon studierna till sjukgymnast vid Umeå universitet, och ersattes samtidigt som assisterande i UIK av gamla anfallskollegan Tina Nordlund).[12]
Inför säsongen 2011 började hon återigen som assisterande tränare i UIK, nu under nye tränaren Joakim Blomqvist.[13]