År 1946 togs massakern upp vid den så kallade Malmedyrättegången inför i en amerikansk militärdomstol i Dachau. Det slutade med att 43 SS-män, däribland Peiper själv, dömdes till döden, 23 till livstids fängelse och 8 fick kortare fängelsestraff. År 1948 uppstod det dock tvivel i den amerikanska senaten om att förhören gått riktigt rätt till, varför en mängd av de dödsdömda benådades. År 1951 utfärdades allmän amnesti och dödsdomarna omvandlades till livstids fängelse. Peiper benådades 1957.