Juusten studerade 1543–1546 vid Wittenbergs universitet och var rektor för katedralskolan i Åbo 1548–1554. Sistnämnda år utnämndes han till den förste biskopen i Viborgs stift och ett decennium senare förflyttades till biskopsstolen i Åbo, där han var biskop 1563–1575.
År 1569 sändes Juusten av kung Johan III som svenskt sändebud till tsar Ivan i Moskva, vars ovilja de svenska legaterna råkade ådra sig. Juusten utsattes för usel behandling och kastades i fängelse och kvarhölls där i tre år. Slutligen frigiven, återkom han till Finland med en förstörd hälsa och avled i sin hemstad Åbo.[3]
År 1574 översatte han Luthers lilla katekes till finska och under vistelsen i Ryssland sammanskrev han för finska prästerskapet en analys av årets predikotexter, som förblev otryckt. Professor Henrik Gabriel Porthan ombesörjde utgivandet av hans berättelse om sin beskickning till Ryssland "Acta legationis moscoviticæ", samt hans Finlands biskopskrönika "Chronicon episcoporum Finlandensium".
Juusten, Paul; Kajanto, Iiro (1995). The tragic mission of bishop Paul Juusten to tsar Ivan the terrible : the itinerary of the delegation to Moscow. Annales Academiae scientiarum Fennicae. Ser. B, 0066-2011 ; 276. Helsinki: Suomalainen tiedeakatemia. Libris7833482. ISBN 951-41-0760-8