FC Vaduz kendi ülkesinde futbol ligi bulunmadığı için İsviçre liglerinde mücadele eden, Lihtenştayn'ın başkenti Vaduz şehrinde kurulan futbol kulübüdür.
İlk Avrupa Kupası maçına 1992-93 sezonunda Uefa Kupa Galipleri Kupası'nda Chornomorets Odesa karşısında çıktı ve rakibine elendi.
1995-96 sezonunda Kupa Galipleri Kupası'nda eşleştiği Hradec Králové takımına elendi.
1996-97 sezonunda Kupa Galipleri Kupası'nda eşleştiği Universitate Riga ile oynadığı iki maçta 1-1 berabere bitti. Rakibini penaltılarda 4-2 ile elemeyi başardı. Sonraki turda Paris Saint-Germain'e elendi.
1998-99 sezonunda Kupa Galipleri Kupası'nda eşleştiği Helsinborg'a elendi.
1999 yılında Kupa Galipleri Kupası kaldırılınca Liechtensteiner Cup şampiyonunun UEFA Kupası'na katılmasına karar verildi. 1999-00 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Bodø/Glimt takımına elendi.
2000-01 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Amica Wronki takımına elendi.
2001-02 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Varteks Varazdin takımına elendi.
2002-03 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Livingston FC takımı ile 1-1 ve 0-0 berabere kaldı. Rakibine deplasman golü ile elendi.
2003-04 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Dnipro takımına elendi.
2004-05 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Longford Town Fc takımını 1-0 ve 3-2 yenerek tur atladı. Bu Vaduz'un Avrupa Kupalarındaki ilk galibiyetidir. Sonraki turda eşleşti Beveren takımına elendi.
2005-06 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Dacia Chișinău takımını elemeyi başarsada sonraki turda Beşiktaş'a elendi.
2006-07 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Újpest FC takımın eledi. Sonraki turda eşleştiği Basel'e deplasman golü ile elendi.
2007-08 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Dinamo Tbilisi'e elendi.
2008-09 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Zrinjski Mostar takımına elendi.
2009-10 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Falkirk FC takımını elemeyi başardı. Sonraki turda eşleştiği Slovan Liberec takımına elendi.
2010-11 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Brondby takımına elendi.
2011-12 sezonunda Uefa Kupası'nda eşleştiği Vojvodina eledi. Sonraki turda eşleştiği Makkabi Tel Aviv takımına elendi.
2013-14 sezonunda Uefa Avrupa Ligi'nde eşleştiği Chikhura takımı ile 1-1 ve 0-0 berabere kaldı. Rakibine deplasman golü ile elendi.
2014-15 sezonunda Uefa Avrupa Ligi'nde eşleştiği Europa FC takımını eledi. Üst turda eşleştiği Ruch Chorzow'a elendi.
2015-16 sezonunda Uefa Avrupa Ligi'nde sırasıyla SP La Fiorita ve Nõmme Kalju eledi. Sonraki turda eşleştiği FC Thun'a deplasman golü ile elendi.
2016-17 sezonunda Uefa Avrupa Ligi'nde Sileks takımını elemeyi başarsa bile sonraki turda FC Midtjylland'a elendi.
2017-18 sezonunda Uefa Avrupa Ligi'nde Bala Town FC takımını eleyerek üst tura çıktı. Sonraki turda Odds takımına elendi.
2018-19 sezonunda Uefa Avrupa Ligi'nde eşleştiği Levski Sofya takımını elemeyi başardı. Sonraki turda Zalgiris Vilnius'a elendi.
2020-21 sezonunda son kez Uefa Avrupa Ligi'nde mücadele etti. COVID-19 pandemisi nedeniyle tek maç üzerinden oynanan karşılaşmada Hibernians FC takımına elendi.
2021-22 sezonunda ilk Konferans Ligi'nde mücadele etti. Eşleştiği Újpest takımına elenerek turnuvaya veda etti.
Not: Uyruk bilgisi futbolcuların FIFA uygunluk kurallarınca oynayabileceği millî takımı gösterir. FIFA kuralları haricinde başkaca uyruğa da sahip olabilirler.
