ADAMTS1

ADAMTS1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JIH, 2V4B, 3Q2G, 3Q2H
Ідентифікатори
Символи	ADAMTS1, C3-C5, METH1, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605174 MGI: 109249 HomoloGene: 21381 GeneCards: ADAMTS1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0070122 peptidase activity; • metalloendopeptidase activity; • hydrolase activity; • metallopeptidase activity;
Клітинна компонента	• extracellular region; • базальна мембрана; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• ovulation from ovarian follicle; • heart trabecula formation; • розвиток нирки; • протеоліз; • integrin-mediated signaling pathway; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9510
	11504
	ENSG00000154734
	ENSMUSG00000022893
	Q9UHI8
	P97857
	NM_006988
	NM_009621
	NP_008919
	NP_033751
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ADAMTS1 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 967 амінокислот, а молекулярна маса — 105 358^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRAVPEGFG	RRKLGSDMGN	AERAPGSRSF	GPVPTLLLLA	AALLAVSDAL
GRPSEEDEEL	VVPELERAPG	HGTTRLRLHA	FDQQLDLELR	PDSSFLAPGF
TLQNVGRKSG	SETPLPETDL	AHCFYSGTVN	GDPSSAAALS	LCEGVRGAFY
LLGEAYFIQP	LPAASERLAT	AAPGEKPPAP	LQFHLLRRNR	QGDVGGTCGV
VDDEPRPTGK	AETEDEDEGT	EGEDEGAQWS	PQDPALQGVG	QPTGTGSIRK
KRFVSSHRYV	ETMLVADQSM	AEFHGSGLKH	YLLTLFSVAA	RLYKHPSIRN
SVSLVVVKIL	VIHDEQKGPE	VTSNAALTLR	NFCNWQKQHN	PPSDRDAEHY
DTAILFTRQD	LCGSQTCDTL	GMADVGTVCD	PSRSCSVIED	DGLQAAFTTA
HELGHVFNMP	HDDAKQCASL	NGVNQDSHMM	ASMLSNLDHS	QPWSPCSAYM
ITSFLDNGHG	ECLMDKPQNP	IQLPGDLPGT	SYDANRQCQF	TFGEDSKHCP
DAASTCSTLW	CTGTSGGVLV	CQTKHFPWAD	GTSCGEGKWC	INGKCVNKTD
RKHFDTPFHG	SWGMWGPWGD	CSRTCGGGVQ	YTMRECDNPV	PKNGGKYCEG
KRVRYRSCNL	EDCPDNNGKT	FREEQCEAHN	EFSKASFGSG	PAVEWIPKYA
GVSPKDRCKL	ICQAKGIGYF	FVLQPKVVDG	TPCSPDSTSV	CVQGQCVKAG
CDRIIDSKKK	FDKCGVCGGN	GSTCKKISGS	VTSAKPGYHD	IITIPTGATN
IEVKQRNQRG	SRNNGSFLAI	KAADGTYILN	GDYTLSTLEQ	DIMYKGVVLR
YSGSSAALER	IRSFSPLKEP	LTIQVLTVGN	ALRPKIKYTY	FVKKKKESFN
AIPTFSAWVI	EEWGECSKSC	ELGWQRRLVE	CRDINGQPAS	ECAKEVKPAS
TRPCADHPCP	QWQLGEWSSC	SKTCGKGYKK	RSLKCLSHDG	GVLSHESCDP
LKKPKHFIDF	CTMAECS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:217 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UHI8 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:217 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9UHI8 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]