GCA

GCA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1F4O, 1F4Q, 1K94, 1K95
Ідентифікатори
Символи	GCA, GCL, grancalcin
Зовнішні ІД	OMIM: 607030 MGI: 1918521 HomoloGene: 22702 GeneCards: GCA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein homodimerization activity; • зв'язування з іоном металу; • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity; • protein heterodimerization activity; • calcium ion binding;
Клітинна компонента	• клітинна мембрана; • екзосома; • мембрана; • extracellular region; • гіалоплазма; • azurophil granule lumen; • цитоплазма;
Біологічний процес	• membrane fusion; • протеоліз; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	25801
	227960
	ENSG00000115271
	ENSMUSG00000026893
	P28676
	Q8VC88
NM_012198; NM_001330265; NM_001330266; NM_001330267; NM_001330268;
	NM_001330270; NM_001330271
	NM_145523
NP_001317194; NP_001317195; NP_001317196; NP_001317197; NP_001317199;
	NP_001317200; NP_036330
	NP_663498
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GCA (англ. Grancalcin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 24 010^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAYPGYGGGF	GNFSIQVPGM	QMGQPVPETG	PAILLDGYSG	PAYSDTYSSA
GDSVYTYFSA	VAGQDGEVDA	EELQRCLTQS	GINGTYSPFS	LETCRIMIAM
LDRDHTGKMG	FNAFKELWAA	LNAWKENFMT	VDQDGSGTVE	HHELRQAIGL
MGYRLSPQTL	TTIVKRYSKN	GRIFFDDYVA	CCVKLRALTD	FFRKRDHLQQ
GSANFIYDDF	LQGTMAI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Teahan C.G., Totty N.F., Segal A.W. (1992). Isolation and characterization of grancalcin, a novel 28 kDa EF-hand calcium-binding protein from human neutrophils. Biochem. J. 286: 549—554. PMID 1530588 DOI:10.1042/bj2860549
Lollike K., Johnsen A.H., Durussel I., Borregaard N., Cox J.A. (2001). Biochemical characterization of the penta-EF-hand protein grancalcin and identification of L-plastin as a binding partner. J. Biol. Chem. 276: 17762—17769. PMID 11279160 DOI:10.1074/jbc.M100965200
Hansen C., Tarabykina S., la Cour J.M., Lollike K., Berchtold M.W. (2003). The PEF family proteins sorcin and grancalcin interact in vivo and in vitro. FEBS Lett. 545: 151—154. PMID 12804766 DOI:10.1016/S0014-5793(03)00518-0
Jia J., Han Q., Borregaard N., Lollike K., Cygler M. (2000). Crystal structure of human grancalcin, a member of the penta-EF-hand protein family. J. Mol. Biol. 300: 1271—1281. PMID 10903868 DOI:10.1006/jmbi.2000.3925
Jia J., Borregaard N., Lollike K., Cygler M. (2001). Structure of Ca(2+)-loaded human grancalcin. Acta Crystallogr. D. 57: 1843—1849. PMID 11717497 DOI:10.1107/S0907444901016511

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15990 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P28676 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.