PSD (ген)

PSD
Ідентифікатори
Символи	PSD, EFA6, EFA6A, PSD1, TYL, pleckstrin and Sec7 domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 602327 MGI: 1920978 HomoloGene: 31115 GeneCards: PSD
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phospholipid binding; • signal transducer activity; • guanyl-nucleotide exchange factor activity;
Клітинна компонента	• клітинна мембрана; • cell projection; • мембрана; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • dendritic spine; • extrinsic component of postsynaptic endosome membrane; • Борозна розщеплення; • ruffle membrane; • postsynaptic density, intracellular component;
Біологічний процес	• regulation of ARF protein signal transduction; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • neuron projection development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5662
	73728
	ENSG00000059915
	ENSMUSG00000037126
	Q86YI3
	Q5DTT2
	NM_001270965; NM_001270966; NM_002779
	NM_028627; NM_001347454
	NP_001257894; NP_001257895; NP_002770; NP_001257895.1
	NP_001334383; NP_082903
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PSD (англ. Pleckstrin and Sec7 domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 024 амінокислот, а молекулярна маса — 109 543^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQGAMRFCS	EGDCAISPPR	CPRRWLPEGP	VPQSPPASMY	GSTGSLLRRV
AGPGPRGREL	GRVTAPCTPL	RGPPSPRVAP	SPWAPSSPTG	QPPPGAQSSV
VIFRFVEKAS	VRPLNGLPAP	GGLSRSWDLG	GVSPPRPTPA	LGPGSNRKLR
LEASTSDPLP	ARGGSALPGS	RNLVHGPPAP	PQVGADGLYS	SLPNGLGGPP
ERLATLFGGP	ADTGFLNQGD	TWSSPREVSS	HAQRIARAKW	EFFYGSLDPP
SSGAKPPEQA	PPSPPGVGSR	QGSGVAVGRA	AKYSETDLDT	VPLRCYRETD
IDEVLAEREE	ADSAIESQPS	SEGPPGTAYP	PAPRPGPLPG	PHPSLGSGNE
DEDDDEAGGE	EDVDDEVFEA	SEGARPGSRM	PLKSPVPFLP	GTSPSADGPD
SFSCVFEAIL	ESHRAKGTSY	TSLASLEALA	SPGPTQSPFF	TFELPPQPPA
PRPDPPAPAP	LAPLEPDSGT	SSAADGPWTQ	RGEEEEAEAR	AKLAPGREPP
SPCHSEDSLG	LGAAPLGSEP	PLSQLVSDSD	SELDSTERLA	LGSTDTLSNG
QKADLEAAQR	LAKRLYRLDG	FRKADVARHL	GKNNDFSKLV	AGEYLKFFVF
TGMTLDQALR	VFLKELALMG	ETQERERVLA	HFSQRYFQCN	PEALSSEDGA
HTLTCALMLL	NTDLHGHNIG	KRMTCGDFIG	NLEGLNDGGD	FPRELLKALY
SSIKNEKLQW	AIDEEELRRS	LSELADPNPK	VIKRISGGSG	SGSSPFLDLT
PEPGAAVYKH	GALVRKVHAD	PDCRKTPRGK	RGWKSFHGIL	KGMILYLQKE
EYKPGKALSE	TELKNAISIH	HALATRASDY	SKRPHVFYLR	TADWRVFLFQ
APSLEQMQSW	ITRINVVAAM	FSAPPFPAAV	SSQKKFSRPL	LPSAATRLSQ
EEQVRTHEAK	LKAMASELRE	HRAAQLGKKG	RGKEAEEQRQ	KEAYLEFEKS
RYSTYAALLR	VKLKAGSEEL	DAVEAALAQA	GSTEDGLPPS	HSSPSLQPKP
SSQPRAQRHS	SEPRPGAGSG	RRKP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504