Едуард Сперцян народився у російському місті Ставрополь і є вихованцем клубу «Краснодар», де почав займатися футболом з десятирічного віку[2]. Футболіст пройшов всі рівні клубної ієрархії. Грав у турнірі ПФЛ у складі «Краснодар-3». У жовтні 2018 року у складі «Краснодар-2» Сперцян дебютував у турнірі ФНЛ.
У сезоні 2020/21 футболіст був заявлений у першій команді на матчі РПЛ і свою дебютну гру провів у вересні 2020 року[3]. Також восени 2020 року Сперцян брав участь у груповому раунді Ліги чемпіонів[4].
Збірна
У лютому 2021 року Едуард Сперцян дав згоду на виступи у складі національної збірної Вірменії[5]. 31 березня у матчі відбору до чемпіонату світу 2022 проти команди Румунії Сперцян дебютував у національній збірній Вірменії. В першому ж матчі Сперцян відзначився забитим голом.