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醫學聲明 。
SARS-CoV-2 变异株科学上准确的SARS-CoV-2的外部结构的原子模型。每个“球”都是一个原子。 世卫组织 指称Gamma 其它名称 20J/501Y.V3、高关注变异株-202101/02(VOC-202101/02)[ 1] 、巴西变种病毒[ 2] [ 3] [ 4] 谱系 P.1 首次检测到 日本东京 报告日期 2021年1月6日,3年前 (2021-01-06 ) 地位 需要关注的变异株 2021年4月21日時點各國P.1譜系病例總數[ 5] 圖示: 超過1000個確診個案
500–999個確診個案
100–499個確診個案
2–99個確診個案
1個確診個案
無確診個案或無數據
嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型-Gamma變異株 (英語:SARS-CoV-2 Gamma variant),別名P.1譜系 (英語:Lineage P.1)[ a] ,是嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型 (SARS-CoV-2)的一種變異株 ,於2021年1月6日首次在日本 東京 發現[ 4] [ 8] 。依據世界衛生組織 命名法,P.1譜系被命名為Gamma變異株,目前Gamma變異株被列為「高關注變異株 」(VOC)[ 9] 。
Gamma變異株一共有17種氨基酸 變化,其中10種發生在刺突蛋白,包括了3種特別引起關注的突變: 「N501Y」、「E484K」和「K417T」[ 4] [ 10] 。
Gamma變異株和在巴西傳播的另一種變異株:Zeta變異株(P.2譜系)有顯著的差異,Zeta變異株只攜帶「E484K」突變,並無其他兩種突變:「N501Y」和「K417T」[ 11] [ 10] 。
歷史
2021年1月6日,日本國立感染症研究所 從四位抵達東京的旅客中檢測出Gamma變異株,他們都曾去過巴西亞馬遜州 [ 4] [ 8] 。Gamma變異株是造成2021年初2019冠狀病毒病 病例在亞馬遜州首府瑪瑙斯 快速增加的原因之一。
2021年1月12日,巴西-英國CADDE中心在瑪瑙斯確認13例P.1譜系病例[ 4] 。在2020年3月至11月期間從瑪瑙斯收集的27份樣本中沒有發現P.1譜系,然而在2020年12月15日至23日期間從同城收集到的樣本中P.1譜系占42%(n=13/31),接著在2020年12月15日至31日期間收集的樣本中P.1譜系占52.2%(n=35/67),在2021年1月1日至9日期間收集的樣本中P.1譜系更達到了85.4%(n=41/48)。從2020年12月下旬到2021年1月9日期間,P.2譜系(Zeta變異株)迅速被P.1譜系取代,瑪瑙斯P.2譜系所占比重由25.4%急劇下降到6.3%[ 4] [ 12] 。
奧斯瓦爾多·克魯茲基金會 研究人員對亞馬遜州250份基因組樣本進行了研究,他們發現相比B.1.1.28譜系和B.1.195譜系病例,P.1譜系感染可以產生大約10倍的病毒載量,傳播力為2.2倍。P.1譜系對於18歲到59歲人群和60歲以上的老年人群具有同等的傳播力,顯示P.1譜系更易在年輕人之間傳播,無性別差異[ 13] 。
CADDE中心的研究顯示P.1譜系傳播力比以往的變異株高兩倍,而且可以避開大約32%的獲得性免疫(比如先前感染冠狀病毒),引發再次感染的可能性。P.1譜系的病死率比以往的變異株高1.5倍[ 14] [ 15] [ 16] 。
病例統計
各國P.1譜系病例(截至2021年8月9日) GISAID[ 17]
國家或地區
病例數
日期
美国
23,373
2021年6月29日
巴西
16,200
2021年6月13日
加拿大
8,070
2021年7月5日
比利时
1,974
2021年7月1日
墨西哥
2,278
2021年6月24日
智利
2,522
2021年6月13日
西班牙
957
2021年6月26日
義大利
2,181
2021年6月29日
荷蘭
566
2021年6月17日
哥伦比亚
346
2021年6月1日
德国
806
2021年6月22日
法國
577
2021年6月23日
千里達及托巴哥
255
2021年6月15日
阿根廷
329
2021年5月12日
法属圭亚那
318
2021年6月11日
英国
224
2021年6月23日
葡萄牙
190
2021年6月23日
乌拉圭
173
2021年4月15日
瑞士
187
2021年6月21日
阿鲁巴
121
2021年6月20日
日本
118
2021年6月13日
苏里南
117
2021年5月25日
瑞典
141
2021年6月14日
巴拉圭
54
2021年5月4日
丹麦
63
2021年6月29日
海地
47
2021年5月20日
盧森堡
2
2021年4月19日
芬兰
7
2021年5月23日
孟加拉国
1
2021年2月18日
巴巴多斯
3
2021年5月22日
开曼群岛
1
2021年6月17日
法罗群岛
1
2021年1月12日
關島
1
2021年4月30日
圭亚那
3
2021年1月18日
菲律賓
2
2021年2月21日
波多黎各
1
2021年6月9日
哥斯达黎加
69
2021年6月29日
厄瓜多尔
145
2021年7月21日
土耳其
88
2021年6月29日
秘魯
42
2021年6月14日
多米尼加
38
2021年6月10日
馬爾他
32
2021年6月22日
愛爾蘭
29
2021年6月21日
奥地利
28
2021年6月18日
波蘭
24
2021年7月14日
捷克
20
2021年6月22日
以色列
19
2021年7月6日
玻利维亚
17
2021年6月2日
委內瑞拉
17
2021年5月26日
库拉索
14
2021年6月24日
羅馬尼亞
12
2021年6月12日
韩国
10
2021年7月3日
挪威
9
2021年7月1日
澳大利亞
8
2021年4月25日
新加坡
8
2021年6月11日
斯洛維尼亞
7
2021年6月4日
新西兰
7
2021年5月31日
克罗地亚
6
2021年6月29日
立陶宛
6
2021年6月30日
约旦
5
2021年4月28日
臺灣
4
2021年1月28日
印度
3
2021年5月12日
波黑
3
2021年7月5日
中國
2
2021年4月17日
巴基斯坦
1
2021年5月17日
安哥拉
1
2021年3月22日
拉脫維亞
1
2021年4月1日
泰國
1
2021年4月5日
俄羅斯
1
2021年5月21日
希腊
1
2021年5月14日
博奈尔
1
2021年7月7日
世界 (71國/地區)
總數:63,769
截至2021年8月9日
變異
Gamma變異株包括兩個子變異株:「28-AM-1」和「28-AM-2」,它們都帶有「K417T」、「E484K」和「N501Y」突變。
Gamma變異株有10種刺突蛋白 突變,包含了N501Y和E484K。
Gamma變異株變異特徵
基因編號
氨基酸
ORF1ab
synT733C
synC2749T
S1188L
K1795Q
del11288-11296 (3675-3677 SGF)
synC12778T
synC13860T
E5665D
刺突蛋白
L18F
T20N
P26S
D138Y
R190S
K417T
E484K
N501Y
H 655Y
T1027I
ORF8
E92K
ins28269-28273
N
P80R
來源:Faria et al. (2021) ,圖 1.B
參見
註釋
^ 其他名稱包括: – 20J/501Y.V3 – 高關注變異株-202101/02 (VOC-202101/02)[ 1] – 巴西變種病毒 (Brazilian variant、Brazil variant)[ 6] [ 7] [ 4]
参考文献
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外部連結