Prvobitno je bio otvoren kao jedan od depandansa Muzeja Sarajeva, a odlukom Skupštine Kantona Sarajevo 2009. godine postaje zasebna javna ustanova ovog kantona.[2]
Postavke muzeja
U prostorijama muzeja, u kulama Ploča i Širokac nalazi se stalna postavka muzeja.[2] U prvoj kuli, postavka je organizirana u devet manjih cjelina. Hronološki postavljena, govori o liku i djelu ovog državnika, od perioda mladosti, preko Sarajevskog procesa do smrti 2003. godine.[2] U ovom dijelu muzeja izložene su i najznačajnije svjetske nagrade i priznanja koje su prvom Predsjedniku Republike Bosne i Hercegovine uručene od strane različitih državnika i međunarodnih institucija.
U drugoj kuli, postavka je posvećena ulozi Alije Izetbegovića kao Vrhovnog komandanta Armije Republike Bosne i Hercegovine i organiziranju otpora u osvitu nadolazećeg rata.[2] Ovaj dio postavke je podijeljen u 6 cjelina. U zidnim vitrinama kule Širokac izloženi su predmeti iz perioda rata u Bosni i Hercegovini kao što su uniforme, ili priznanja koje je Alija Izetbegović dobio od vojnika.
Osim stalne postavke, Muzej "Alija Izetbegović" organizuje i pokretnu postavku. Ovaj vid postavke organiziran je u 27 cjelina, također hronološki postavljenih s temom života i djela Alije Izetbegovića.
Za razliku od stalne, pokretna postavke je pogodna da izlaganje prilikom različitih manifestacija i događaja ne samo u Sarajevu već i po potrebi širom Bosne i Hercegovine i svijeta, gdje god postoje poštovaoci života i djela ovog državnika.
