Share to: share facebook share twitter share wa share telegram print page

Virofág

Jak číst taxoboxVirofágy
alternativní popis obrázku chybí
Virofág Sputnik
Baltimorova klasifikace virů
SkupinaI (dsDNA viry)
Vědecká klasifikace
RealmVaridnaviria
ŘíšeBamfordvirae
KmenPreplasmiviricota
TřídaMaveriviricetes
ŘádPriklausovirales
ČeleďLavidaviridae
rody
  • Sputnikvirus
  • Mavirus
    viz text
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Virofágy (z latinského virus - jed a řeckého φάγειν fágein - jíst) jsou malé viry s dvouřetězcovou DNA, které pro infekci hostitele vyžadují spoluinfekci jiného viru. Spoluinfikující viry jsou obvykle obří viry. Virofágy se při vlastní replikaci spoléhají na replikační aparát spoluinfikujícího obřího viru. Jednou z vlastností virofágů je jejich parazitický vztah vzhledem ke spoluinfikujícímu viru; jejich závislost na replikaci obřího viru často vede až k deaktivaci spoluinfikujících obřích virů. (Tím se liší od ostatních satelitních virů, s jednořetězcovou RNA či DNA, které jsou pro spoluinfikující viry neškodné.) Virofág tak může zlepšit zotavení a přežití hostitelského organismu.

Druhy

Dosud (polovina r. 2015) je známo přibližně 20 druhů, náležících ke čtyřem vývojovým liniím.

První z virofágů, Sputnik, byl objeven ve virových částicích rodu Mamavirus, jehož hostitelem je améba Acanthamoeba polyphaga. Jeho velikost je 50 nm, genom má 18 343 bp a 3 geny pravděpodobně patřící Mamaviru. Jeho příbuzným by mohl být čtvrtý objevený virofág, Sputnik 2, objevený r. 2012 ve virech Lentille příbuzných rodu Mimivirus (náleží do stejné čeledi Mimiviridae). V jeho DNA jsou totiž fragmenty známé z virofágu Sputnik. Je unikátní tím, že může vsunout svou DNA do genomu svého hostitele. Obsahuje fragmenty DNA, nově nazvané transpovirony, které se chovají podobně jako transpozony v buněčných hostitelích.[1][2][3] Sputnik 3 byl objeven v r. 2013.[4] Do stejné vývojové linie patří i několik později objevených virofágů: Phaeocystis globosa virus virophage objevený v r. 2013,[5] o rok později popsaný Zamilon, parazitující na obřím viru Mont1 (Mimiviridae),[6] Zamilon 2, objevený v r. 2015, nebo Miers Valley soil virophage, odhalený r. 2014 v environmentálních vzorcích z antarktické půdy.[7]

Druhým objeveným virofágem, ale odlišné vývojové linie než Sputnik, je Mavirus, který napadá Cafeteria roenbergensis virus (CroV), patogen dravého mořského bičíkovce Cafeteria roenbergensis. Genom má 19 063 bp a obsahuje retrovirové integrázy a DNA polymerázy B. Sekvence DNA je nejpodobnější eukaryotickým transpozonům, což by svědčilo pro jejich virový původ. Buňky si tak zřejmě snaží pomoci v boji proti CroV. Ke stejné linii patří později (2013) objevený Ace Lake Mavirus (ALM).[8]

Třetí objevený virofág, Organic Lake virophage (OLV), odlišné vývojové linie než výše uvedené, byl objeven roku 2011 ve slaném antarktickém jezeře Organic Lake. Parazituje na virech Phycodnaviridae, napadajících řasy.[9] Jeho průměr je ~100 nm a genom tvoří 26 421 bp. Do stejné skupiny patří i později (2013) objevené druhy skupiny Yellowstone Lake virophages (v r. 2017 je jich známo sedm: YLSV1 až YLSV7), jejichž kompletní genomy byly získány molekulární analýzou metagenomických sekvencí odebraných z Yellowstonského jezera,[8] jakož i Dishui Lake virophages a Qinghai Lake virophage, metagenomickou analýzou objevené ve vzorcích z východočínského jezera Dishui v r. 2015, resp. Tibetského jezera Čching-chaj-chu v r. 2016.[10][11]

V r. 2015 byl publikován objev nové, čtvrté vývojové linie virofágů, tzv. rumen virophages (RVP), nalezených molekulární analýzou v metagenomických sekvencích získaných ze střev ovcí. Pravděpodobně parazitují na mimivirech. Vyznačují se několika odlišnostmi ve složení a unikátní stavbou, která naznačuje, že mohly vzniknout jako chiméry virofága a polintoviru.[12]

Systematika

Všechny známé virofágy jsou řazeny do společné čeledi Lavidaviridae.

Metagenomické analýzy umožnily od r. 2008, kdy byl objeven první virofág, identifikovat již stovky virofágových genomů. Protože k nim však absentují replikující izoláty, neumožňuje být jejich objev klasifikován v systému ICTV. Proto nadále (k r. 2019) zůstávají pouze dva uznané rody virofágů, a sice Sputnikvirus (se dvěma oficiálně uznanými druhy Mimivirus-dependent virus Sputnik, Mimivirus-dependent virus Zamilon) a Mavirus (s jediným oficiálně uznaným druhem Cafeteriavirus-dependent mavirus), třebaže by OLV, YSLV a RVP nové rody vyžadovaly.[13]

Význam

Virofágy dokáží zprostředkovat horizontální přenos mezi viry, obdobně jako jiné viry mezi buňkami. Jelikož jsou pro své hostitele smrtící, slouží takřka jako pomocníci buněk v boji proti virům, které je napadají. Z hlediska léčby virových onemocnění jde o objev velice zajímavý, i když například medicínsky významné viry z čeledí Retroviridae nebo Orthomyxoviridae jsou příliš malé a nemohou proto sloužit jako hostitelé virofágů.

Odkazy

Reference

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Organic Lake virophage na anglické Wikipedii.

  1. ↑ DESNUES, Christelle; LA SCOLA, Bernard; YUTIN, Natalya, FOURNOUS, Ghislain; ROBERT, Catherine; AZZA, Saïd; JARDOT, Priscilla; MONTEIL, Sonia; CAMPOCASSO, Angélique; KOONIN, Eugene V.; RAOULT, Didier. Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses. S. 18 078 – 18 083. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 15. říjen 2012. Svazek 109, čís. 44, s. 18 078 – 18 083. Dostupné online. DOI 10.1073/pnas.1208835109. PMID 23071316. (anglicky) 
  2. ↑ YIRKA Bob: Researchers discover a giant virus in an amoeba that contains a provirophage (popularizační článek k předchozí referenci). PhysOrg, 16. říjen 2012 (anglicky)
  3. ↑ MIHULKA Stanislav: Divoký svět sekvencí uvnitř améby z kontaktních čoček. O.S.E.L., 18. říjen 2012
  4. ↑ Gaia_2013; PAGNIER, Isabelle; CAMPOCASSO, Angélique; FOURNOUS, Ghislain; RAOULT, Didier; LA SCOLA, Bernard. Broad Spectrum of Mimiviridae Virophage Allows Its Isolation Using a Mimivirus Reporter. PLoS ONE [online]. 2013-04-15. Svazek 8, čís. 4: e61912. Dostupné online. Dostupné také na: [1]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0061912. PMID 23596530. (anglicky) 
  5. ↑ SANTINI, Sebastien, et al. Genome of Phaeocystis globosa virus PgV-16T highlights the common ancestry of the largest known DNA viruses infecting eukaryotes. S. 10800–10805. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 25. červen 2013. Svazek 110, čís. 26, s. 10800–10805. Dostupné online. Dostupné také na: [2]. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1303251110. (anglicky) 
  6. ↑ GAIA, Morgan; BENAMAR, Samia; BOUGHALMI, Mondher, PAGNIER, Isabelle; CROCE, Olivier; COLSON, Philippe; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. Zamilon, a Novel Virophage with Mimiviridae Host Specificity. S. 1–8. PLoS ONE [online]. 18. duben 2014. Svazek 9, čís. 4: e94923, s. 1–8. Dostupné online. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0094923. PMID 24747414. (anglicky) 
  7. ↑ ZABLOCKI, Olivier; ZYL, Leonardo Joaquim van; ADRIAENSSENS, Evelien M.; RUBAGOTTI, Enrico; TUFFIN, Marla; CARY, Stephen Craig; COWAN, Donald A. High-Level Diversity of Tailed Phages, Eukaryote-Associated Viruses, and Virophage-Like Elements in the Metaviromes of Antarctic Soils. S. 6888–6897. Applied and Environmental Microbiology [online]. Listopad 2014 [cit. 2017-03-02]. Svazek 80, čís. 22, s. 6888–6897. Dostupné online. Dostupné také na: [3]. ISSN 1098-5336. DOI 10.1128/AEM.01525-14. PMID 25172856. (anglicky) 
  8. ↑ a b ZHOU, Jinglie; ZHANG, Weijia; YAN, Shuling, XIAO, Jinzhou; ZHANG, Yuanyuan; LI, Bailin; PAN, Yingjie; WANG, Yongjie. Diversity of virophages in metagenomic data sets. S. 4225–4236. Journal of Virology [online]. 13. únor 2013. Svazek 87, čís. 8, s. 4225–4236. Dostupné online. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.03398-12. PMID 23408616. (anglicky) 
  9. ↑ 'Virus-eater' discovered in Antarctic lake : Nature News [online]. [cit. 2012-06-16]. Dostupné online. 
  10. ↑ Chaowen Gong; Weijia Zhang; Xuewen Zhou; Hongming Wang; Guowei Sun; Jinzhou Xiao; Yingjie Pan, SHULING YAN, YONGJIE WANG. Novel Virophages Discovered in a Freshwater Lake in China. Frontiers in Microbiology [online]. Frontiers Media SA, 22. leden 2016 [cit. 2017-03-02]. Svazek 7: 5. Dostupné online. Dostupné také na: [4]. DOI 10.3389/fmicb.2016.00005. PMID 26834726. (anglicky) 
  11. ↑ OH, Seungdae; YOO, Dongwan; LIU, Wen-Tso. Metagenomics Reveals a Novel Virophage Population in a Tibetan Mountain Lake. S. 173–177. Microbes and Environments [online]. Nakanishi Printing, 3. květen 2016 [cit. 2017-03-02]. Svazek 31, čís. 2, s. 173–177. Dostupné online. Dostupné také na: [5]. ISSN 1347-4405. DOI 10.1264/jsme2.ME16003. (anglicky) 
  12. ↑ YUTIN, Natalya; KAPITONOV, Vladimir V; KOONIN, Eugene V. A new family of hybrid virophages from an animal gut metagenome. S. 1–9. Biology Direct [online]. 25. duben 2015. Svazek 10, čís. 19, s. 1–9. Dostupné online. PDF [6]. DOI 10.1186/s13062-015-0054-9. PMID 25909276. (anglicky) 
  13. ↑ PAEZ-ESPINO, David; ZHOU, Jinglie; ROUX, Simon, et al. Diversity, evolution, and classification of virophages uncovered through global metagenomics. Microbiome [online]. BioMed Central Ltd., part of Springer Nature, 2019-12-10. Svazek 7: 157. Dostupné online. Dostupné také na: [7]. ISSN 2049-2618. DOI 10.1186/s40168-019-0768-5. PMID 31823797. (anglicky) 

Literatura

Lhotský, Josef. Úvod do studia symbiotických interakcí mikroorganismů. Nový pohled na viry a bakterie. Praha, Academia, 2015, 208 s, s. 51-54.

Externí odkazy

Read other articles:

Underwater logging

Process of harvesting trees that are submerged under water Underwater logging is the process of logging trees from underwater forests. When artificial reservoirs and dams are built, large areas of forest are often inundated; although the trees die, the wood is often preserved. The trees can then be felled using special underwater machinery and floated up to the surface. One such machine is the sawfish harvester. There is an ongoing debate to determine whether or not underwater logging is a su...

 

Latgalian language

Eastern Baltic language For the language spoken by the ancient Latgalian tribe, see Latvian language § History. This article needs additional citations for verification. Please help improve this article by adding citations to reliable sources. Unsourced material may be challenged and removed.Find sources: Latgalian language – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (April 2008) (Learn how and when to remove this template message) Latgalianlat...

 

Раковіца (комуна, Бреїла)

У Вікіпедії є статті про інші значення цього терміна: Раковіца. комуна РаковіцаRacovița Країна  Румунія Повіт  Бреїла Телефонний код +40 239 (Romtelecom, TR)+40 339 (інші оператори) Координати 45°17′55″ пн. ш. 27°28′02″ сх. д.H G O Висота 23 м.н.р.м. Площа 45,33 км² Населення 1231[1] (200...

History of college campuses and architecture in the United States

Aspect of American architectural history The history of college campuses in the United States begins in 1636 with the founding of Harvard College in Cambridge, Massachusetts, then known as New Towne. Early colonial colleges, which included not only Harvard, but also College of William & Mary, Yale University and The College of New Jersey (now Princeton University), were modeled after equivalent English and Scottish institutions, but American establishments gradually split with their foreb...

 

Wong (Marvel Cinematic Universe)

Marvel Cinematic Universe character Fictional character WongMarvel Cinematic Universe characterBenedict Wong as Wong in She-Hulk: Attorney at Law (2022).First appearanceDoctor Strange (2016)Based onWongby Steve Ditko    Stan LeeAdapted by Jon Spaihts Scott Derrickson C. Robert Cargill Portrayed byBenedict WongIn-universe informationTitleSorcerer SupremePreceeded by: Ancient OneOccupationSorcererAffiliationMasters of the Mystic Arts Wong is a fictional character in the Marv...

 

Equipa da Superleague Fórmula do Futebol Clube do Porto

Nota: Este artigo refere-se apenas à equipa de Superleague Fórmula do FC Porto. Se procura informação sobre o clube em geral ou sobre outra(s) modalidades(s), consulte o artigo Futebol Clube do Porto.O Futebol Clube do Porto é um clube desportivo da cidade do Porto, Portugal, onde se praticam diversas modalidades. O presente artigo é sobre a sua equipa de Superleague Fórmula. Equipa da Superleague Fórmula do F.C. Porto Fundada/1ª Ronda 2008 / Ronda 1 - 2008 Fechada/Última Ronda...

Benh Zeitlin

Benh ZeitlinZeitlin at the Deauville American Film Festival, September 2012LahirBenjamin Harold Zeitlin[1]14 Oktober 1982 (umur 41)Manhattan, New York, Amerika SerikatPekerjaanPembuat film, komponis, animatorKarya terkenalBeasts of the Southern Wild Benjamin Harold Benh Zeitlin (lahir 14 Oktober 1982)[2] adalah seorang pembuat film, komponis, dan animator asal Amerika yang dikenal karena menyutradarai film tahun 2012 Beasts of the Southern Wild. Kehidupan dan karier Zeitl...

 

Internet Speculative Fiction Database

Si ce bandeau n'est plus pertinent, retirez-le. Cliquez ici pour en savoir plus. Cet article ne s'appuie pas, ou pas assez, sur des sources secondaires ou tertiaires (août 2023). Pour améliorer la vérifiabilité de l'article ainsi que son intérêt encyclopédique, il est nécessaire, quand des sources primaires sont citées, de les associer à des analyses faites par des sources secondaires. Internet Speculative Fiction DatabaseHistoireFondation 1995CadreType Base de données en ligne, ba...

 

Piala Champions Eropa 1968–1969

Piala Champions Eropa 1968–69Santiago Bernabéu Stadium in Madrid hosted the final.Informasi turnamenJadwalpenyelenggaraan18 September 1968 – 28 Mei 1969Jumlahtim peserta32Hasil turnamenJuara Milan (gelar ke-2)Tempat kedua AjaxStatistik turnamenJumlahpertandingan52Jumlah gol176 (3,38 per pertandingan)Pencetak golterbanyak Denis Law (9 gol)← 1967–68 1969–70 → Piala Champions Eropa 1968-69 dimenangkan oleh Milan setalah mengalahkan AFC Ajax dengan skor 4-1 di babak fina...

Japanese destroyer Hatsushimo (1933)

Hatsuharu-class destroyer For other ships with the same name, see Japanese destroyer Hatsushimo. Hatsushimo in 1937 History Empire of Japan NameHatsushimo Ordered1931 Fiscal Year BuilderUraga Dock Company Laid down31 January 1933 Launched4 November 1933 Commissioned27 September 1934 Stricken30 September 1945 FateMined and run aground, 30 July 1945. Broken up 1948-1949 General characteristics Class and typeHatsuharu-class destroyer Displacement1,802 long tons (1,831 t) Length 103.5 m...

 

Brackettville, Texas

City in Texas, United StatesBrackettville, TexasCityKinney County courthouseLocation of Brackettville, TexasCoordinates: 29°18′55″N 100°24′54″W / 29.31528°N 100.41500°W / 29.31528; -100.41500CountryUnited StatesStateTexasCountyKinneyArea[1] • Total3.17 sq mi (8.21 km2) • Land3.17 sq mi (8.21 km2) • Water0.00 sq mi (0.00 km2)Elevation[2]1,106 ft (337 m)...

 

Saint-Bonnet-de-Bellac

Peta infrastruktur dan tata guna lahan di Komune Saint-Bonnet-de-Bellac.  = Kawasan perkotaan  = Lahan subur  = Padang rumput  = Lahan pertanaman campuran  = Hutan  = Vegetasi perdu  = Lahan basah  = Anak sungaiSaint-Bonnet-de-Bellac merupakan sebuah komune di departemen Haute-Vienne di Prancis. Lihat pula Komune di departemen Haute-Vienne Referensi INSEE lbsKomune di departemen Haute-Vienne Aixe-sur-Vienne Ambazac Arnac-la-Poste Augne Aureil Azat-le-Ri...

Museo Cantini

Museo Cantini UbicaciónPaís  FranciaLocalidad MarsellaDirección 19 rue Grignan13006 MarsellaCoordenadas 43°17′32″N 5°22′41″E / 43.29225, 5.3781666666667Historia y gestiónCreación 1936Inauguración 1936Museo Cantini[editar datos en Wikidata] El Museo Cantini (en francés: Musée Cantini) es un museo francés fundado en 1936 y con sede en Marsella que recoge en sus salas arte moderno y contemporáneo y desde 1968 realiza exposiciones de fotografía....

 

Plan of San Luis Potosí

This article needs additional citations for verification. Please help improve this article by adding citations to reliable sources. Unsourced material may be challenged and removed.Find sources: Plan of San Luis Potosí – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (November 2020) (Learn how and when to remove this template message) 1910 Mexican political document by revolutionary leader Francisco I. Madero Porfirio Díaz, president at the start of the...

 

Спір Олександр Олександрович

Спір Олександр ОлександровичНародився 1770Помер 1862Країна  Російська імперіяДіяльність лікарДіти Спір Африкан Олександрович Олекса́ндр Олекса́ндрович Спір [також Шпір, нім. Spir] — (*1770 — †1862), лікар, філософ й медичний діяч родом з Херсонщини. Батько Африкана Спіра...

Knurr and spell

Old English pub game Nipsy redirects here. For the nickname, see Nipsey. Knurr and spell (also called northern spell,[1] nipsy or trap ball) is an old English game, once popular as a pub game. Yorkshiremen playing knurr and spell, ca. 1814. History The game originated in the moors of Yorkshire, in England, but then spread throughout the north of England.[2] It can be traced back to the beginning of the 14th century.[citation needed] It was especially popular in the 18t...

 

Railroad Tycoon 3

For other uses, see Railroad Tycoon (disambiguation). 2003 video gameRailroad Tycoon 3Developer(s)PopTop SoftwareBeenox (Mac)[2]Publisher(s)GatheringProducer(s)Chris LaceyDesigner(s)Phil SteinmeyerProgrammer(s)Phil SteinmeyerArtist(s)Franz FelslComposer(s)Jim CallahanSeriesRailroad TycoonPlatform(s)Windows, OS XReleaseWindowsNA: October 27, 2003[1]EU: October 31, 2003OS XNovember 22, 2004Genre(s)Business simulationMode(s)Single-player, multiplayer Railroad Tycoon 3 is a video ...

 

Derbi Manchester

Derbi ManchesterSeragam tradisional dari Man City (kiri) dan Man United (kanan)LokasiManchester RayаTim terlibatManchester CityManchester UnitedPertemuan pertama12 November 1881St. Mark's (West Gorton) 0–3 Newton Heath LYRPertemuan termutakhir29 Oktober 2023Liga Utama InggrisUnited 0–3 CityPertemuan selanjutnya2 Maret 2024Liga Utama InggrisCity v UnitedStadionCity of Manchester (City)Old Trafford (United)StatistikTotal pertemuan191Kemenangan terbanyakManchester United (78)Penampilan terb...

Chronology of the liberation of Dutch cities and towns during World War II

Map of the liberation of North Brabant and Dutch Zeeland (Battle of the Scheldt). This is a chronological overview of the dates at which the liberation by the Allies in World War II took place of a number of Dutch cities and towns. On Mad Tuesday (5 September 1944) Allies forces reached the southern border of the Netherlands. After the Allies crossed the Rhine in March 1945, Canadian forces entered the Netherlands from the east. The final liberation of remaining cities and towns came with cap...

 

Biul Kalimantan

Biul Kalimantan Status konservasi Terancam (IUCN 3.1)[1] Klasifikasi ilmiah Kerajaan: Animalia Filum: Chordata Kelas: Mamalia Ordo: Carnivora Famili: Mustelidae Genus: Melogale Spesies: M. everetti Nama binomial Melogale everetti(Thomas, 1895) Sebaran biul Kalimantan Biul Kalimantan[2] (Melogale everetti) atau juga dikenal sebagai Biul Kinabalu adalah suatu hewan yang merupakan anggota dari keluarga Mustelidae (cerpelai). Nama ilmiah everetti digunakan untuk mengenan...

 
Kembali kehalaman sebelumnya