Byens historie er kort; det hele startede i 1905, da der ved jernbanen mellem Seoul og Busan blev anlagt en station på et område kaldet Hanbat. Siden har jernbanestationen udviklet sig til at blive en af landets største byer.
I 1993 blev verdensudstillingenExpo '93 afholdt i byen. Efter begivenheden blev Expo-parken omdannet til en science park, hvor man blandt andet afholder Korean Science Festival. Under VM i fodbold 2002 blev flere kampe spillet på Daejeon World Cup Stadium. Byen har desuden været aktuel som en mulig alternativ hovedstad i Sydkorea.