Die Weser fließt östlich in 2 km Entfernung. Südöstlich von Magelsen mündet die Hoyaer Emte in die Weser.
Die von Bremen über Nienburg/Weser nach Hannover führende B 6 verläuft südwestlich 15 km entfernt, während die von Verden (Aller) über Nienburg nach Minden verlaufende B 215 östlich – auf der anderen Seite der Weser – in 4 km Entfernung verläuft.
In Magelsen gibt es keine Straßenbezeichnungen, sondern nur Hausnummern, nach denen sich Einwohner, Postboten, Lieferanten und Besucher orientieren müssen.
Seit dem 1. März 1974 gehört die bis dahin selbständige Gemeinde zu Hilgermissen.[1]
↑Statistisches Bundesamt (Hrsg.): Historisches Gemeindeverzeichnis für die Bundesrepublik Deutschland. Namens-, Grenz- und Schlüsselnummernänderungen bei Gemeinden, Kreisen und Regierungsbezirken vom 27. 5. 1970 bis 31. 12. 1982. W. Kohlhammer GmbH, Stuttgart und Mainz 1983, ISBN 3-17-003263-1, S.191.
