Miniature Inverted-repeat Transposable Element

Ein Miniature Inverted-repeat Transposable Element (MITE, dt. ‚miniatur-transposables Element mit wiederholenden Endsequenzen‘) ist ein transponibles DNA-El…

Ein Miniature Inverted-repeat Transposable Element (MITE, dt. ‚miniatur-transposables Element mit wiederholenden Endsequenzen‘) ist ein transponibles DNA-Element mit Inverted Repeats.[1]

Eigenschaften

MITE sind als transponible Elemente eine Form eigennütziger DNA und kommen in Archaeen,[2] Bakterien,[3] Pflanzen[4] und Tieren vor.[5][6] MITE sind nicht autonom replizierend, da sie vermutlich auf die Nutzung einer Transposase aus anderen verwandten Transposons angewiesen sind.[1] An beiden Enden der meist unter 500 Basenpaaren langen doppelsträngigen DNA-Sequenz eines MITE befinden sich wiederholende Endsequenzen (inverted repeats), die ursprünglich die Einfügung des MITE an dieser Stelle des Genoms ermöglicht hatten und die Rekombination des MITE mit anderen genomischen Bereichen ermöglicht. MITE kommen gehäuft in entfalteten, transkriptionsaktiven Bereichen vor.[7][8]

MITE werden anhand ihrer Homologie zu Transposons in verschiedene Familien unterteilt: PIF/Harbinger, Tc1/mariner, PiggyBac, hAT, P element und Mutator.[1][9]

Literatur

Einzelnachweise

  1. ↑ a b c I. Fattash, R. Rooke, A. Wong, C. Hui, T. Luu, P. Bhardwaj, G. Yang: Miniature inverted-repeat transposable elements: discovery, distribution, and activity. In: Genome / National Research Council Canada = Génome / Conseil national de recherches Canada. Band 56, Nummer 9, September 2013, ISSN 1480-3321, S. 475–486, doi:10.1139/gen-2012-0174, PMID 24168668.
  2. ↑ K. Brügger, P. Redder, Q. She, F. Confalonieri, Y. Zivanovic, R. A. Garrett: Mobile elements in archaeal genomes. In: FEMS microbiology letters. Band 206, Nummer 2, Januar 2002, ISSN 0378-1097, S. 131–141, PMID 11814653.
  3. ↑ N. Delihas: Small mobile sequences in bacteria display diverse structure/function motifs. In: Molecular microbiology. Band 67, Nummer 3, Februar 2008, ISSN 0950-382X, S. 475–481, doi:10.1111/j.1365-2958.2007.06068.x, PMID 18086200, PMC 2229807 (freier Volltext).
  4. ↑ P. Sampath, J. Murukarthick, N. K. Izzah, J. Lee, H. I. Choi, K. Shirasawa, B. S. Choi, S. Liu, I. S. Nou, T. J. Yang: Genome-wide comparative analysis of 20 miniature inverted-repeat transposable element families in Brassica rapa and B. oleracea. In: PloS one. Band 9, Nummer 4, 2014, S. e94499, ISSN 1932-6203, doi:10.1371/journal.pone.0094499, PMID 24747717, PMC 3991616 (freier Volltext).
  5. ↑ G. L. Wallau, P. Capy, E. Loreto, A. Hua-Van: Genomic landscape and evolutionary dynamics of mariner transposable elements within the Drosophila genus. In: BMC genomics. Band 15, 2014, ISSN 1471-2164, S. 727, doi:10.1186/1471-2164-15-727, PMID 25163909, PMC 4161770 (freier Volltext).
  6. ↑ E. Satovic, M. Plohl: Tandem repeat-containing MITEs in the clam Donax trunculus. In: Genome biology and evolution. Band 5, Nummer 12, 2013, ISSN 1759-6653, S. 2549–2559, doi:10.1093/gbe/evt202, PMID 24317975, PMC 3879986 (freier Volltext).
  7. ↑ Q. Zhang, J. Arbuckle, S. R. Wessler: Recent, extensive, and preferential insertion of members of the miniature inverted-repeat transposable element family Heartbreaker into genic regions of maize. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. Band 97, Nummer 3, Februar 2000, ISSN 0027-8424, S. 1160–1165, PMID 10655501, PMC 15555 (freier Volltext).
  8. ↑ C. Feschotte, N. Jiang, S. R. Wessler: Plant transposable elements: where genetics meets genomics. In: Nature Reviews Genetics. Band 3, Nummer 5, Mai 2002, ISSN 1471-0056, S. 329–341, doi:10.1038/nrg793, PMID 11988759.
  9. ↑ C. Feschotte, X. Zhang, S. R. Wessler: Miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs) and their relationship with established DNA transposons. In: Mobile DNA II. Edited by N. Craig, R. Craigie, M. Gellert, and A. Lambowitz. American Society for Microbiology Press, Washington, D.C. 2002, S. 1147–1158.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.