Stygiolobus
Stygiolobus ist eine Gattung von Archaeen in der Familie Sulfolobaceae.[1][3][4] Typusart ist Stygiolobus azoricus.[1][4]…
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| Systematik | ||||||||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||
| Stygiolobus | ||||||||||||
| Segerer et al. 1991[1][2] |
Stygiolobus ist eine Gattung von Archaeen in der Familie Sulfolobaceae.[1][3][4] Typusart ist Stygiolobus azoricus.[1][4][2]
Beschreibung
Die Mitglieder der Gattung Stygiolobus, repräsentiert durch ihre Typusart S. azoricus mit Referenzstamm FC6, sind anaerobe, extrem thermoacidophile (hitze- und säureliebende) Archaeen der Ordnung Sulfolobales. Wie in der Erstbeschreibung 1991 berichtet, konnten die Isolate FC6, FC4 und RG1 bei 80 °C und einem pH-Wert von 3,0 (fast so sauer wie Essig) kultiviert werden. Die FC6-Zellen lysieren bei pH-Werten über etwa 7,5 bis 8. Für die 1991er Erstbeschreibung wurden insgesamt 11 anaerobe Proben aus kochenden Solfatarquellen, Schlamm und Böden auf der Azoren-Insel São Miguel entnommen. Die Temperatur- und pH-Bereiche vor Ort lagen zwischen 72 und 102 °C bzw. pH 2,0 und 5,5. Im Detail:[2]
| Entnahmeort | Anzahl Proben |
Anz. positiver Proben |
In situ Temp. (°C) |
In situ pH |
Stamm |
|---|---|---|---|---|---|
| Furnas Caldeiras | 7 | 2 | 72 / 80 | 2 / 3 | FC4 / FC6 |
| Caldeiras da Ribeira grande | 1 | 1 | 80 | 4 | RG1 |
Die Zellwände enthalten Muraminsäure und Meso-Diaminopimelinsäure (2,6-Diaminopimelinsäure, DAP). Der G+C-Gehalts beträgt etwa 38 mol%. Die 1991er Analysen legten eine Klassifizierung in die Familie Sulfolobaceae (Ordnung Sulfolobales) nahe. Aufgrund ihrer streng anaeroben Lebensweise, der fehlenden signifikanten DNA-Homologie mit anderen Mitgliedern der Sulfolobales und ihres G+C-Gehalts unterschieden sich die drei Stämme jedoch von den vier zuvor beschriebenen Gattungen dieser Ordnung, was Anlass für die Aufstellung der damals neuen Gattung Stygiolobus mit ihrer Typusart gab.[2]
Artenliste
Die derzeit akzeptierte Taxonomie basiert auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[1] und dem National Center for Biotechnology Information (NCBI),[3] ergänzt um Einträge aus der Genome Taxonomy Database (GTDB),[4] Stand: 26. Dezember 2025:
Gattung (Biologie) Stygiolobus Segerer et al. 1991(L,N,G)[2] [Stygiolobus Segerer et al. 1991 emend. Sakai et al. 2022(N)]
- Spezies Stygiolobus azoricus Segerer et al. 1991(L,N,G)[2] (Typusart(L,G)[2])
- Stamm DSM 6296(L,N)[2] alias JCM 9021(L,N) oder FC6(L,N,G)[2] – Fundort: Furnas Caldeiras, São Miguel, Azoren[2]
- Stamm FC4[2] – Fundort: Furnas Caldeiras, São Miguel, Azoren[2]
- Stamm RG1[2] – Fundort: Caldeiras da Ribeira grande, São Miguel, Azoren[2]
- Spezies Stygiolobus caldivivus Sakai et al. 2022(L) [Stygiolobus sp. KN-1(N)[5]]
- Stamm JCM 34622 alias KCTC 4293(L,N) oder KN-1(L,N,G)[5] – Fundort: Dai Kyokan Jigoku,[6] Präfektur Nagasaki. Japan
- Spezies Stygiolobus sp037389425(G) [Stygiolobus sp. CP850M(N), Stygiolobus sp. RP850M(N), Stygiolobus sp. CP8521M(N), Stygiolobus sp. CP859M(N), [Sulfolobaceae archaeon RBS.bin.8[7]]
- Stamm CP850M(N,G) – Fundort: Cinder Pool (CP), im Bogen des Tantalus Creek nordwestlich vom Constant Geyser,[8] One Hundred Spring Plain (OSP), Yellowstone-Nationalpark, USA(N)
- Stamm CP8521M(N,G) – Fundort: ebenda(N)
- Stamm CP859M(N,G) – Fundort: ebenda(N)
- Stamm RP850M(N,G) – Fundort: Realgar Spring/Pond (RP),[9] Norris-Geysir-Becken, Yellowstone-Nationalpark, USA(N)
- Stamm RSEP2(G) – Fundort: ENVO:0000207, Thermalquelle im Yellowstone Lake, Yellowstone-Nationalpark, USA(G)
- Stamm RBS.bin.8(G) – Fundort: 'Red Bubbler' Spring (RBS) am Tantalus Creek, West-Südwest vom Rediscovered Geyser[10] Norris-Geysir-Becken, Yellowstone-Nationalpark, USA[7]
- L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ)[1]
- N – Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI)[3]
- G – Genome Taxonomy Database (GTDB)[4]
Wo nicht anders angegeben ist der erste Stamm (bzw. das erste MAG) Typusstamm (englisch type strain) für die jeweilige Spezies.
Viren

Stygiolobus-Vertreter werden von Viren der Familie Rudiviridae parasitiert, darunter dem Stygiolobus rod-shaped virus (SRV; Spezies Azorudivirus furnasense, früher Azorudivirus SRV) mit stäbchenförmigen Virionen. SRV hat ein lineares dsDNA-Genom mit einer Länge von 28.096 bp (Basenpaaren).[11]
Etymologie
Der Gattungsname Stygiolobus setzt sich zusammen aus dem lateinischen Adjektiv stygius ‚vom Styx‘, ‚zum Styx gehörig‘, ‚aus der Unterwelt‘; sowie lobus ‚Lappen‘. Der Name bezeichnet also einen lappigen Organismus aus dem Hades lobe; N.L. masc. n. Stygiolobus.[1]
- Das Art-Epitheton azoricus ist ein neulateinisches Adjektiv mit der Bedeutung ‚von den Azoren‘, ‚zu den Azoren gehörig‘, was sich auf den Ort der erstmaligen Isolation der Art bezieht.[1]
- Das Art-Epitheton caldivivus setzt sich zusammen aus den lateinischen Adjektiven caldus ‚heiß‘ und vivus ‚lebend‘, es verweist damit auf einen in einer heißen Umgebung lebenden Organismus.[1]
Weiterführende Literatur
- Gisle Vestergaard, Shiraz A. Shah, Ariane Bize: Stygiolobus Rod-Shaped Virus and the Interplay of Crenarchaeal Rudiviruses with the CRISPR Antiviral System. In: Journal of Bacteriology, Band 190, Nr. 20, 15. Oktober 2008, S. 6837–6845; doi:10.1128/JB.00795-08, PMC 2566220 (freier Volltext), PMID 18723627 (englisch).
- Karl O. Stetter: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Hrsg.: J. T. Staley, M. P. Bryant, N. Pfennig, J. G Holt. 1. Auflage. Band 3. The Williams & Wilkins Co., Baltimore 1989, Order III. Sulfolobales ord. nov. Family Sulfolobaceae fam. nov., S. 169 (englisch).
Einzelnachweise
- ↑ a b c d e f g h LPSN: Genus Stygiolobus Segerer et al. 1991.
- ↑ a b c d e f g h i j k l m n Andreas H. Segerer, Antonio Trincone, Manfred Gahrtz, Karl O. Stetter: Stygiolobus azoricus gen. nov., sp. nov. represents a novel genus of anaerobic, extremely thermoacidophilic archaebacteria of the order Sulfolobales. In: International Journal of Systematic Bacteriology (International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology), Band 41, Nr. 4, 1. Oktober 1991, S. 495–501; doi:10.1099/00207713-41-4-495 (englisch).
- ↑ a b c NCBI Taxonomy Browser: Candidatus Stygiolobus, Details: Segerer et al. 1991 (genus), homotypic synonym: Stygiolobus Segerer et al. 1991 emend. Sakai et al. 2022; graphisch: Stygiolobus, auf Lifemap.
- ↑ a b c d GTDB: Stygiolobus.
- ↑ a b Koichi Nakamura, Norio Kurosawa, Hiroyuki D. Sakai: Complete Genome Sequence of a Novel Thermoacidophilic and Facultatively Anaerobic Crenarchaeon, Stygiolobus sp. Strain KN-1. In: Environmental Microbiology: Microbiology Resource Announcements, Band 10, Nr. 39, 30. September 2021; doi:10.1128/mra.00581-21, ResearchGate:354971203 (englisch).
- ↑ Dai Kyokan Jigoku. Auf: Google Maps.
- ↑ a b NCBI: Genome assembly ASM3224893v1. GCA_032248935.1: Sulfolobaceae archaeon RBS.bin.8.
- ↑ Constant Geyser. Auf GeoNames.
- ↑ Realgar Spring. Auf: GeoNames.
- ↑ Rediscovered Geyser. Auf MapCarta (de).
- ↑
ICTV: Taxon name: Azorudivirus furnasense. Dazu:
- ICTV: 2020.141B.R.Rudiviridae.zip (docx & xlsx).
- NCBI Taxonomy Browser: Stygiolobus rod-shaped virus.
- NCBI Nucleotide: Stygiolobus rod-shaped virus.
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