1561 (MDLXI) fue un año común comenzado en miércoles del calendario juliano.

• 26 de febrero: En Bolivia, el español Ñuflo de Chávez funda Santa Cruz de la Sierra.
• 2 de marzo: el español Pedro del Castillo funda la Ciudad de Mendoza, actual capital de la provincia argentina del mismo nombre.
• 31 de marzo: En Venezuela, el español Juan de Maldonado funda la aldea de San Cristóbal.
• 14 de abril: en Núremberg (Alemania), al amanecer se desarrolla el Fenómeno celeste en Núremberg de 1561, guardado en registros por Hans Glaser , observado por pobladores y registrado dentro de periódicos locales. Siendo uno de los fenómenos mas misteriosos de la Edad Moderna
• 4 de mayo: en Cartagena (España), Luis Fajardo de la Cueva, ii marqués de los Vélez, repele un ataque del corsario otomano Uluj Alí contra la ciudad en la batalla de Santa Mónica.
• 8 de mayo: En España, el rey Felipe II traslada la Corte desde Toledo a la villa de Madrid, que se convierte desde esa época en la capital.
• Desde fines de mayo a junio se produce en Calabria, Reino de Nápoles, la "matanza de los valdenses". Las poblaciones de religión Valdense (Protestante desde 1532), proveniente de los Valles Valdenses del Piamonte que se establecieron en Calabria desde el siglo XIII.^[1]​
• 5 de junio: en el Municipio de Cavour, en el Piamonte, Italia, se firma la Paz de Cavour, o Paz de los Valdenses.
• 20 de agosto: en la actual provincia de Jujuy (Argentina), Juan Pérez de Zurita funda la aldea de Nieva. Debido a los malos tratos contra los indios omaguacas, en 1563 estos se rebelan e incendian la ranchería.
• 22 de agosto: se funda la ciudad de Ocozocoautla, en el Virreinato de Nueva España.
• 20 de octubre: los hugonotes provocan una matanza de católicos en la Catedral de Montpellier.
• 21 de noviembre: Potosí adquiere el rango de ciudad mediante una capitulación expedida por el entonces virrey del Perú Diego López de Zúñiga y Velasco, conde de Nieva, exentándola de la jurisdicción de la ciudad de La Plata.

• Luis de Góngora: poeta y dramaturgo español.
• Francis Bacon: filósofo renancentista.
• Santorio Santorio: médico italiano.
• Hernando Arias de Saavedra hidalgo,militar,conquistador,explorador y funcionario en la Gobernación del Río de la Plata y del Paraguay.

• 6 de enero: Ridolfo Ghirlandaio, pintor florentino (n. 1483).
• Alonso Berruguete, escultor español.
• Olivier de Magny, poeta francés.
• Rüstem Pasha, esposo de Mihrimah Sultan y gran visir del Imperio Otomano.
• Claude Garamond, impresor y tipógrafo francés.
• Andrés Hurtado de Mendoza, marqués de Cañete, y virrey del Perú.
• Sayri Túpac, hijo de Manco Inca Yupanqui.
• 25 de septiembre: Şehzade Bayezid, hijo del sultán solimán y la hurrem sultán

• Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre 1561.