Elle a été mise en service progressivement de 1975 à 2008. À l'origine, l'extrémité nord entre Villy-le-Pelloux et Scientrier était connectée à l'A40 près de La Roche-sur-Foron. Depuis , l'extrémité nord est connectée à l'autoroute suisse A1, au sud du canton de Genève. Cette section de 19,6 km est payante. Elle est concédée à l'ADELAC mais opérée par l'Area. En raison de ses nombreux ouvrages d'art (viaduc des Usses, tranchée couverte du Noiret, viaduc du Nant de Saint-Martin, tunnel du Mont-Sion, viaduc du Nant de la Folle), elle est une des plus chères de France. En 2020, le tarif est 5,10 € (0,26 €/km) entre l'A40 et Cruseilles[1], et même 7,90 € (0,29 €/km) jusqu'à Annecy-Nord. La vitesse y est limitée à 110 km/h en raison de son profil accidenté. ; l'ancienne section de Villy-le-Pelloux à Scientrier constitue désormais l'A410.
l'A41 Sud : 41 km de longueur ; principalement 2 × 2 voies, 2 × 3 voies vers Grenoble ;
l'A41 Nord : 71 km de longueur ; principalement 2 × 2 voies avec une 3e voie pour véhicules lents dans les montées raides, 2 × 3 voies de l'A40 à la frontière suisse et également de l'échangeur 17 d'Annecy Nord a l'échangeur 18 et la gare de péage de St Martin Bellevue -jonction A41-A410).
Histoire
1967 : ouverture de la section Grenoble – Le Touvet pour les Jeux olympiques d'hiver de 1968 de 1×2 voies mis en double sens, sur une seule chaussée. C'est le précurseur de l'autoroute. Gratuit.
1976 : mise en double de la section Grenoble – Le Touvet et ouverture jusqu'à Pontcharra. Mise en place de la barrière de péage de Crolles. Il y a aussi des cabanes de péage sur les entrées/sorties Crolles - Brignoud en direction de Grenoble, rendant l'autoroute payante jusqu'à Domène, Montbonnot-Saint-Martin.
1978 : ouverture de la section Pontcharra – Chambéry-Sud - La Ravoire. Mise en place de la barrière de péage de Chambéry-Sud. La VRU n'étant pas achevée, une circulation à double sens en 1 × 2 voies est mise en place sur une seule chaussée jusqu'à la RN6, à l'entrée de Barberaz.
1978 : ouverture de la section Annecy-sud - Annecy-nord.
1982 : abolition du péage depuis Crolles - Brignoud vers Grenoble et inversement.
1985 : jonction de la Rocade Sud de Grenoble et réorganisation des entrées/sorties de Meylan dans le même secteur dont création d'une bretelle vers Chambéry. Ajout de l'entrée Meylan-mi-plaine en direction de Grenoble.
1987 : ouverture de la sortie Aix-les-Bains-sud.
1989 : mise en service de l'échangeur de Francin pour l'ouverture de la section de l'A43 entre l'échangeur de Francin et Montmélian. Le tronçon de l'A41 entre Chambéry/RN 201 et Francin est renuméroté A43.
1993 : ajout d'une troisième voie entre l'entrée Montbonnot-Saint-Martin et l'embranchement de la Rocade Sud.
1995 : ajout d'une troisième voie entre l'embranchement de la Rocade Sud et la sortie Montbonnot-Saint-Martin. Mise en service du demi-diffuseur de la Bâtie depuis et vers Grenoble. Le 5 décembre 1994, lors des travaux de goudronnage de la bretelle, une pluie s'abat sur le chantier, créant un épais brouillard. Un carambolage s'ensuit, causant la mort de 5 personnes[2].
1996 : au niveau de la commune de Méry, le virage serré prévu pour l'embranchement du contournement autoroutier est de Chambéry (devant rejoindre la section sud à la Ravoire) est reprofilé pour permettre un passage à pleine vitesse.
vers 2000 : dédoublement de la sortie 24 pour séparer les flux venant de Grenoble et allant à Brignoud (sortie 24b) et à Crolles (sortie 24a) respectivement.
2002 : modification de l'échangeur avec la Rocade sud: la sortie Meylan en venant de Grenoble n'est plus accessible depuis l'A41.
2006 : ouverture de la sortie vers Bernin en venant de Grenoble.
2008 : ouverture de la section Annecy – Genève directe (19,7 km construite en 38 mois pour 871,5 millions d’euros)[3] permettant de mettre Annecy à 30 minutes du centre de Genève. Cette section se nomme Liane (LIaison Annecy Nord Express). Mise en service le à 14 heures. Trafic attendu : 23 000 véhicules par jour. L'ancienne section qui part de la barrière de Saint-Martin-Bellevue jusqu'à l'A40 (par la Roche-sur-Foron) se nomme dorénavant A410[4]. L'autoroute A401 qui reliait l'A40 au poste frontière de Bardonnex et qui se trouve maintenant connectée à l'extrémité de l'A41, est intégrée à cette dernière.
2010 : ouverture de la sortie 15.1 de Seynod-Sud, relié à la RD 1201.
2015 : ouverture de l'entrée depuis Bernin vers Grenoble.
2018 : depuis septembre, travaux d'aménagement et d'élargissement avec mise en 2 × 3 voies entre le péage 17 Annecy Nord et le péage de Saint-Martin-Bellevue.
2019 : l'échangeur de la Bâtie est complété en direction de Chambéry.
2023 : la bretelle d'accès à l'autoroute A41 depuis Chambéry par l'A43 / VRU(N201) a été déplacée dans la zone commerciale des Landiers (secteur Pré Pagnon) afin de réduire le trafic routier au niveau du péage historique de l'A43 et de fluidifier la traversée de l'agglomération de Chambéry lors des grands chassé/croisé hivernaux à destination des stations de ski savoyardes et italiennes. Cette nouvelle bretelle d'accès est équipée d'un innovant système de péage sans barrière enregistrant les plaques d'immatriculation par caméras lors du passage de tous les véhicules.
Contournement de Chambéry
Il était prévu à l'origine de connecter les deux sections Nord et Sud de l'autoroute au niveau de la traversée de Chambéry[réf. nécessaire]. Le tronçon autoroutier manquant devait démarrer au sud d'Aix-les-Bains, entre les villages de Méry et Sonnaz[réf. nécessaire]. Un échangeur autoroutier était prévu dans la courbe décrite par la section Nord de l'A41, un espace entre les deux chaussées ayant été aménagé dès la construction de cette section de l'autoroute mise en service en 1977[réf. nécessaire]. Se dirigeant vers le sud, l'autoroute devait passer à l'est de Sonnaz disposant d'un diffuseur connecté à la D211, franchir la colline de Lémenc en tunnel sous le col de Saint-Saturnin, passer entre Bassens et Saint-Alban-Leysse et se connecter à la section Sud de l'A41 entre Barberaz et la Ravoire[réf. nécessaire]. Au total, la section prévue à péage devait mesurer dix kilomètres de longueur[réf. nécessaire].
Ce projet est abandonné dans les années 1980[réf. nécessaire], notamment avec l'aménagement de la RN 201 (passage progressif à 2x2 voies puis 2x3 voies et ouverture du tunnel des Monts), et l'emprise de l'échangeur à Méry est modifiée en 1996 par le reprofilage de la chaussée sud qui est depuis collée à la chaussée nord. Un nouveau projet de contournement de Chambéry, cette fois-ci par le sud, proposé en 2007 à lui aussi été abandonné en 2014[réf. nécessaire].
26 Meylan - est à 3 km : Meylan (trois-quarts-échangeur, pas d'entrée vers Grenoble. Sortie dans le sens Grenoble-Chambéry uniquement en arrivant de la Rocade sud)
En 2021, des travaux sont en cours au niveau de la gare de péage de Chambéry-Nord et de l'échangeur A41-A43-VRU, avec en particulier la création d'une bretelle autoroutière depuis la VRU vers l'A41 en direction d'Aix-les-Bains et Annecy afin de réduire les cisaillements des différents flux automobiles[5].
Le 15 septembre 2022, le nouvel échangeur ouvre après 1 an et demi de travaux.