Les fouilles archéologiques montrent que le site est occupé depuis au moins 3 000 ans. Au Xe siècle, la localité a une place du marché et un petit port sur la Zgłowiaczka. Vers l’an 1000, la ville est transformée en place forte et devient le siège d’un duc. Włocławek devient également le siège d’un évêché en 1163. Au Moyen Âge, la localité portait le nom de Włodzisław. Par la suite son nom se transforme en Włocław (Vladislavia). Casimir Ier de Cujavie lui accorde les privilèges urbains avant 1265.
De 1308 à 1332, la ville est confrontée aux tentatives d’invasion des chevaliers teutoniques. Elle est totalement détruite en 1329. La ville est reconstruite à partir de 1339, elle reçoit le droit de Chełmno et une cathédrale est édifiée de 1340 à 1365. En 1392 et en 1431, la ville souffre encore d’attaques de l’Ordre teutonique. Ce n’est que le Traité de Thorn de 1466 qui met fin à la menace teutonique et qui permet à la ville de prospérer. Elle devient le centre du commerce des céréales sur la Vistule. Les greniers à blé bourgeonnent. Ils sont au nombre de 27 en 1598. La ville compte 245 habitations.
Les commerçants de la ville possèdent leur propre flotte marchande. La ville, au cœur d’une région agricole très fertile (Cujavie et région de Dobrzyń), s’enrichit considérablement. Parallèlement, l’artisanat se développe. La mise en place d’un réseau d’égouts en bois témoigne de l’aisance de la ville à cette époque.
En 1657, Włocławek est pillé et incendié par les Suédois. À partir de là, les malheurs s’abattent sur la ville (guerres, épidémies, incendies) et provoquent un déclin brutal. La ville se dépeuple. Le nom de Włocław disparait et est remplacé par Włocławek (Petit Włocław). En 1760, il ne reste plus que 2 greniers à blé et 155 maisons.
Durant la Seconde Guerre mondiale, la ville, annexée par les Allemands qui la renomment Leslau, est détruite à 30 %. La communauté juive (près de 25 % de la population) est déportée au ghetto de Łódź puis exterminée. La ville est libérée le par l'Armée rouge.
IV LO im. Kamila Krzysztofa Baczyńskiego, ul. Kaliska 108
V LO im. Unii Europejskiej, ul. Toruńska 77/83
Économie
Après la dernière guerre, les vieilles entreprises sont reconstruites et modernisées (la papeterie, la fabrique de faïence, l’usine Wisła produisant du matériel agricole, l’entreprise produisant des concentrés alimentaires). De nouvelles entreprises sont fondées. Elles produisent de l’azote, de la peinture et du vernis, des céramiques, du fil de fer, des manomètres, des meubles, des produits alimentaires, etc. Une centrale hydroélectrique est construite sur la Vistule. Le développement industriel s’accompagne de la construction de nouveaux logements et de l’aménagement de nouvelles infrastructures urbaines.
Aujourd’hui, Włocławek est devenu le plus important centre industriel, administratif, commercial et culturel de la Cujavie orientale.