Come le precedenti costruzioni (una carolingia ed una ottoniana), è situata sulla sponda sinistra del Reno. Il fiume si trova dalla parte del coro, il quale a sua volta si appoggia su una piccola altura artificiale a forma di terrazza (il cui nome è Pfalz). Grazie alle sue pareti esterne che danno sul fiume, questa terrazza è chiaramente sopraelevata rispetto alla sponda. La piazza antistante l'edificio, lunga e stretta, è di fattura prevalentemente barocca.
La chiesa è costruita sotto forma di basilica a tre navate. Se si conta la presenza di cappelle laterali comunicanti tra di loro, la chiesa conta cinque navate. La facciata è dominata dalle due torri gotiche leggermente diverse tra di loro. Con un'altezza di 64 metri, quella settentrionale supera leggermente la torre meridionale (il cui completamento nel 1500 segnava ufficialmente quello della chiesa).
Un elemento di indubbio valore per la chiesa è la porta di San Gallo, entrata del transetto nordoccidentale. Si tratta di una delle maggiori opere scultoree dell'epoca romanica in Svizzera. La costruzione è dotata di un doppio chiostro dal lato sudorientale.
Molte delle sculture originali sono state portate in un museo per garantirne una migliore conservazione e sostituite da copie. Il tetto è caratterizzato dalla grazia dei motivi romboidali ottenuti con tegole colorate.
L'organo
L'interno, dotato di una cripta, conserva le spoglie di Erasmo da Rotterdam nella navata nordoccidentale. È relativamente spoglio e si distingue per la presenza di matronei prettamente romanici coronati da arcate cieche.
Organo a canne
L'attuale organo a canne, costruito nel 2003 dalla ditta organariaMathis Orgelbau con cassa progettata dal sangallesePeter Märkli, è l'ultimo di una serie di strumenti che si sono susseguiti nel corso dei secoli, il più antico dei quali realizzato nel XIV secolo. A trasmissione mista (meccanica per i manuali, elettrica per i registri), ha quattro tastiere di 58 note ciascuna ed una pedaliera di 30 per un totale di 78 registri.
Galleria d'immagini
Veduta esterna della chiesa
Portale di San Gallo
Pianta del monastero di Basilea; sulla destra, i due chiostri
