Le prime citazioni risalgono al 1356 e dell'originario edificio rimane visibile solo il campaniletardogotico, anche se rimaneggiato in epoche successive. L'attuale struttura è a navata unica con cappella addossata sul lato sinistro e sormontata da cupola. Le caratteristiche sono quelle dello stile barocco, essendo la chiesa stata oggetto di profondi interventi durante il XVII secolo. La chiesa parrocchiale di San Lorenzo, oggi visibile, edificata tra il 1624 e il 1637 dall'architetto Andrea Storace.
La facciata esterna ha linee semplici ed è decorata a fasce orizzontali bicolori in tipico stile ligure. All'interno si conservano alcune opere di rilievo quali un polittico di San Lorenzo del 1584,
Nella zona di Varigotti sorgono inoltre i seguenti edifici religiosi: l'oratorio di Sant'Antonio, adiacente alla parrocchiale, e la vecchia chiesa di San Lorenzo sulle colline che sovrastano la Baia Dei Saraceni, immediatamente dietro Punta Crena, la collina che si erge da barriera tra il borgo di Varigotti e l'insenatura naturale utilizzata in passato come porto, distrutto in epoca antica dalla flotta genovese.